105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3399 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 483 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  74.29 
 
 		 509 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  71.37 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  78.07 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  47.68 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  45.4 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  41.79 
 
 		 459 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  38.45 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  35.85 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.2 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  38.31 
 
 		 468 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  41.71 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.73 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  40.62 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  39.73 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  37.79 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  39.25 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  37.26 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  40.52 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  38.11 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  39.45 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  41.75 
 
 		 361 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.88 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  37.37 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  38.83 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  41.16 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  37.93 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.64 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  36.82 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  37.4 
 
 		 489 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  37.77 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  37.12 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  38.05 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  39.47 
 
 		 457 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  38.42 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.05 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  38.7 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  37.97 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  37.34 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  35.65 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  39.95 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  36.34 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  38.54 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.45 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  39.5 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  38.4 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  37.98 
 
 		 433 aa  156  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.17 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  35.33 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  37.79 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  39.21 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.44 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  38.1 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  34.94 
 
 		 464 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.71 
 
 		 523 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  34.85 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  38.31 
 
 		 840 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.65 
 
 		 673 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.72 
 
 		 759 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.37 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.97 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.92 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.32 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.77 
 
 		 1296 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.01 
 
 		 852 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  34.19 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.39 
 
 		 2160 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.49 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  26.92 
 
 		 2192 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.17 
 
 		 1037 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.3 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.25 
 
 		 523 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.01 
 
 		 591 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.46 
 
 		 884 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  32.17 
 
 		 1755 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  26.58 
 
 		 1234 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.31 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.49 
 
 		 717 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  28.84 
 
 		 1252 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1010 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  34.4 
 
 		 1332 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  27.91 
 
 		 1250 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  27.91 
 
 		 1250 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.91 
 
 		 1234 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  27.91 
 
 		 1234 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1023 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.86 
 
 		 1197 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.13 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  24.82 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.17 
 
 		 518 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  27.17 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  30.58 
 
 		 593 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  29.92 
 
 		 870 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  26.74 
 
 		 1672 aa  46.2  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  27.06 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1106 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2313  hypothetical protein  24.85 
 
 		 834 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  35.48 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  24.91 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>