45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2405 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1216    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  45.08 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.12 
 
 		 593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  30.26 
 
 		 591 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.52 
 
 		 575 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  28.84 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 		 575 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1061 aa  75.1  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.9 
 
 		 2192 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.54 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  26.55 
 
 		 659 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  25.88 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.16 
 
 		 2042 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.83 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1106 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.86 
 
 		 1197 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  33.09 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  25.86 
 
 		 665 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.31 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  28.18 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  25.58 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  27.72 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  28.19 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  26.6 
 
 		 362 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  27.94 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  40.85 
 
 		 655 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 		 817 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1010 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  23.41 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  25 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.52 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  27.85 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  25.38 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  26.82 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  32.73 
 
 		 786 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  26.27 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  26.52 
 
 		 454 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  26.16 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  26.09 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  24 
 
 		 775 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  31.75 
 
 		 1037 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>