42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2393 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 659 aa  1329    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  81.64 
 
 		 665 aa  1043    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  31.5 
 
 		 655 aa  216  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  32.79 
 
 		 591 aa  173  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  32.77 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  32.14 
 
 		 591 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  31.95 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  32.57 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  30.11 
 
 		 572 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.74 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30.34 
 
 		 575 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  33.46 
 
 		 384 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.45 
 
 		 767 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.72 
 
 		 2192 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1061 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.87 
 
 		 759 aa  94  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 302 aa  94  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.32 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  33.68 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.34 
 
 		 530 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.6 
 
 		 2042 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.55 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.67 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  37.8 
 
 		 870 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.42 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  28.49 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  28.87 
 
 		 647 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.12 
 
 		 2160 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  44.44 
 
 		 362 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  47.62 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  29.56 
 
 		 731 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.14 
 
 		 1197 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  49.15 
 
 		 546 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  29.29 
 
 		 717 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  27.52 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  27.14 
 
 		 913 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  43.86 
 
 		 786 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1106 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  25.59 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.24 
 
 		 1800 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  36.05 
 
 		 422 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.85 
 
 		 1254 aa  43.9  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>