44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0376 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 870 aa  1664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1061 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  56.92 
 
 		 2042 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  37.8 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  53.45 
 
 		 2192 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  61.67 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  58.33 
 
 		 655 aa  62  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  31.75 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  48.39 
 
 		 759 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.98 
 
 		 563 aa  54.7  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  30.71 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 575 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  43.59 
 
 		 647 aa  51.6  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  39.33 
 
 		 471 aa  51.2  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  27.78 
 
 		 483 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  44.62 
 
 		 530 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  34.34 
 
 		 509 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  47.14 
 
 		 1241 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  47.62 
 
 		 864 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  37.76 
 
 		 870 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  54.9 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  33.56 
 
 		 566 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  62.79 
 
 		 1263 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  50 
 
 		 2082 aa  48.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  41.86 
 
 		 331 aa  48.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  47.62 
 
 		 839 aa  47.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  46.03 
 
 		 4357 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 		 913 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.93 
 
 		 1879 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.46 
 
 		 601 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  39.44 
 
 		 3542 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 		 692 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  40 
 
 		 461 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  40.66 
 
 		 456 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  35.06 
 
 		 454 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  26.36 
 
 		 477 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  30.16 
 
 		 477 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  35.56 
 
 		 1577 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  37.8 
 
 		 361 aa  45.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.93 
 
 		 561 aa  45.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30 
 
 		 623 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  42.86 
 
 		 1222 aa  44.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  52.27 
 
 		 1390 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  45.05 
 
 		 1672 aa  44.3  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>