42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1858 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 1081 aa  2137    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.23 
 
 		 1095 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  37.79 
 
 		 720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  40.11 
 
 		 331 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  46.21 
 
 		 940 aa  101  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  43.51 
 
 		 864 aa  99.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 2117 aa  95.5  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  41.57 
 
 		 845 aa  95.5  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  40.49 
 
 		 456 aa  92.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.43 
 
 		 726 aa  91.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  36.36 
 
 		 582 aa  89  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  40.57 
 
 		 841 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  39.44 
 
 		 514 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  33.71 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  37.8 
 
 		 2002 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  33.11 
 
 		 835 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  36.42 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  32 
 
 		 1027 aa  65.1  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  45.78 
 
 		 1263 aa  64.7  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.4 
 
 		 1222 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.93 
 
 		 1323 aa  59.7  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  42.52 
 
 		 2042 aa  58.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1076 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  35.62 
 
 		 321 aa  57.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.03 
 
 		 1407 aa  56.2  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1387 aa  55.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.77 
 
 		 561 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45.07 
 
 		 1355 aa  53.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.54 
 
 		 4357 aa  52.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.69 
 
 		 607 aa  51.2  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  38.16 
 
 		 1004 aa  50.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  43.96 
 
 		 561 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  54.9 
 
 		 870 aa  48.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1390 aa  48.5  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  33.55 
 
 		 792 aa  48.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 531 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.95 
 
 		 363 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  29.79 
 
 		 432 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.49 
 
 		 826 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.64 
 
 		 247 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  41.46 
 
 		 1527 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  35.8 
 
 		 300 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>