19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2564 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  47.81 
 
 		 1695 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.85 
 
 		 859 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.15 
 
 		 336 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.08 
 
 		 1394 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  45.86 
 
 		 2042 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  52.24 
 
 		 757 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.82 
 
 		 14944 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.98 
 
 		 12684 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  53.62 
 
 		 1310 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14944  predicted protein  25.93 
 
 		 4372 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  44.44 
 
 		 1081 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  40.91 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  40.23 
 
 		 556 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92778  predicted protein  27.08 
 
 		 1716 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.17 
 
 		 740 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.82 
 
 		 1876 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  37.06 
 
 		 1672 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.23 
 
 		 597 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>