26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2341 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 757 aa  1528    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.36 
 
 		 2042 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  30.03 
 
 		 1672 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  66.67 
 
 		 1394 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  64.37 
 
 		 1310 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  58.87 
 
 		 1672 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  59.77 
 
 		 859 aa  89.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  53.97 
 
 		 1673 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.41 
 
 		 1848 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  55.17 
 
 		 336 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  46.1 
 
 		 1035 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  46.46 
 
 		 1902 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  53.42 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  55.06 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  39.6 
 
 		 1695 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0654  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.53 
 
 		 311 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.21 
 
 		 311 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  52.24 
 
 		 247 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  44.32 
 
 		 14944 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40 
 
 		 1095 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.56 
 
 		 1876 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  40.26 
 
 		 14609 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  41.76 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  47.76 
 
 		 1527 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5222  hypothetical protein  41.89 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  30.68 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>