101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5222 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5222  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  30.25 
 
 		 1463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  27.1 
 
 		 1987 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.29 
 
 		 735 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.08 
 
 		 675 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.18 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.1 
 
 		 1120 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  30.09 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  28.81 
 
 		 2122 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.87 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.4 
 
 		 713 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.07 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1682 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.82 
 
 		 669 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  26.32 
 
 		 1189 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.05 
 
 		 1094 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.73 
 
 		 978 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.59 
 
 		 1969 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.05 
 
 		 2272 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  28.12 
 
 		 1241 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.51 
 
 		 1620 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.05 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  26.86 
 
 		 1882 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  28.64 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  27.47 
 
 		 1361 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1916 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.89 
 
 		 1842 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  28.57 
 
 		 1095 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.73 
 
 		 1606 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.41 
 
 		 786 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  22.7 
 
 		 971 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  33.33 
 
 		 945 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.51 
 
 		 910 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  27.82 
 
 		 530 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 845 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.43 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.79 
 
 		 1300 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.18 
 
 		 615 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.57 
 
 		 2036 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.92 
 
 		 963 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.66 
 
 		 1230 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  47.76 
 
 		 1282 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  24.43 
 
 		 791 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.55 
 
 		 1356 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  33.78 
 
 		 650 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  27.46 
 
 		 547 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.55 
 
 		 3295 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.96 
 
 		 752 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  48 
 
 		 2042 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.69 
 
 		 1095 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  24.51 
 
 		 2000 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.32 
 
 		 1862 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  34.78 
 
 		 951 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  32.53 
 
 		 2554 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.55 
 
 		 1732 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  26.03 
 
 		 551 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  29.76 
 
 		 941 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.13 
 
 		 2552 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  26.34 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  30.34 
 
 		 719 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 918 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  34.31 
 
 		 840 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  25.5 
 
 		 958 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.07 
 
 		 1371 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  27.27 
 
 		 1011 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  32.85 
 
 		 184 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  27.93 
 
 		 769 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1667 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  26.38 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  31.98 
 
 		 1236 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1340  PKD domain-containing protein  51.22 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  42.47 
 
 		 1310 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.89 
 
 		 757 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  28.57 
 
 		 935 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  23.97 
 
 		 859 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  30.82 
 
 		 819 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  32.31 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  35.51 
 
 		 965 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.45 
 
 		 1667 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 802 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.03 
 
 		 838 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  56.41 
 
 		 930 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.5 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  26.75 
 
 		 517 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 870 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  33.94 
 
 		 1387 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  23.72 
 
 		 1528 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.74 
 
 		 1602 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  25.2 
 
 		 861 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.27 
 
 		 1814 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  51.35 
 
 		 561 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  54.84 
 
 		 771 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  31.47 
 
 		 929 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.54 
 
 		 1466 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  28.37 
 
 		 951 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  25.36 
 
 		 952 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.6 
 
 		 1531 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  58.06 
 
 		 967 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  29.33 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3865  hypothetical protein  36.99 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>