91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5804 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 
1394 aa  2560    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  51.62 
 
 
1695 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.92 
 
 
859 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  61.96 
 
 
2042 aa  179  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  38.02 
 
 
1672 aa  177  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  49.85 
 
 
336 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14944  predicted protein  26.56 
 
 
4372 aa  157  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  45.53 
 
 
247 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  46.79 
 
 
1222 aa  126  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  68.6 
 
 
757 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.91 
 
 
726 aa  111  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.63 
 
 
740 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  38.37 
 
 
3911 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31813  predicted protein  29.14 
 
 
1581 aa  108  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.209863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  58.9 
 
 
1848 aa  105  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  39.73 
 
 
1232 aa  104  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92778  predicted protein  25.99 
 
 
1716 aa  104  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  40.57 
 
 
14944 aa  102  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  68.24 
 
 
1310 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.94 
 
 
1673 aa  94.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  31.49 
 
 
1544 aa  93.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  45.65 
 
 
1879 aa  90.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.67 
 
 
12684 aa  82.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  40.43 
 
 
1532 aa  82  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.02 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  36.77 
 
 
1626 aa  79  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.24 
 
 
3544 aa  75.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  56.86 
 
 
556 aa  74.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.79 
 
 
1095 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.05 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 
1272 aa  72  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  33.11 
 
 
1170 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  35.26 
 
 
629 aa  70.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  45.45 
 
 
2296 aa  70.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  36.11 
 
 
1527 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  26.6 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  37.88 
 
 
3209 aa  69.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  52.71 
 
 
1035 aa  68.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  39.79 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.47 
 
 
692 aa  67.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.46 
 
 
3542 aa  67  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  34.9 
 
 
300 aa  66.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  41.41 
 
 
891 aa  64.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  31.61 
 
 
618 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
1876 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.2 
 
 
2522 aa  63.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  41.67 
 
 
1672 aa  62  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  31.77 
 
 
14609 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 
497 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.6 
 
 
2402 aa  60.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  36.67 
 
 
968 aa  60.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.29 
 
 
2853 aa  60.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  50 
 
 
813 aa  59.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.65 
 
 
887 aa  59.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  35.83 
 
 
2392 aa  58.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
1284 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.34 
 
 
350 aa  57  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15263  predicted protein  33.7 
 
 
357 aa  57  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.510611  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.08 
 
 
3699 aa  56.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.17 
 
 
878 aa  56.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  45.07 
 
 
311 aa  56.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  49.23 
 
 
471 aa  56.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  38.83 
 
 
1732 aa  55.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2490  hypothetical protein  41.67 
 
 
448 aa  55.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.44 
 
 
1779 aa  55.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 
11716 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 
4231 aa  54.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  23.76 
 
 
857 aa  53.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  34.83 
 
 
683 aa  53.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  32.82 
 
 
409 aa  53.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 
3699 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.94 
 
 
3563 aa  52.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  31.32 
 
 
2001 aa  52.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.62 
 
 
2636 aa  52  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  38.71 
 
 
672 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  41.96 
 
 
2820 aa  51.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  34.21 
 
 
378 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  55 
 
 
815 aa  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  48.57 
 
 
1081 aa  49.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  34.62 
 
 
1504 aa  48.5  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  40.62 
 
 
609 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.39 
 
 
344 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_93102  predicted protein  29.34 
 
 
1360 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283763  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.84 
 
 
4465 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 
597 aa  47.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.28 
 
 
323 aa  47.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  33.04 
 
 
2079 aa  47.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  40.86 
 
 
1129 aa  46.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  31.95 
 
 
2886 aa  47  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  34.87 
 
 
3244 aa  45.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31833  predicted protein  24.27 
 
 
1133 aa  45.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0358806  normal  0.410614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>