53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1453 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.03 
 
 		 2002 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  44.83 
 
 		 940 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  38.37 
 
 		 845 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.9 
 
 		 2117 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.95 
 
 		 726 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  38.69 
 
 		 720 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  36.96 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  38.05 
 
 		 675 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  38.55 
 
 		 582 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  44.38 
 
 		 841 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  33.16 
 
 		 835 aa  99.4  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  37.75 
 
 		 514 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.19 
 
 		 1323 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  36.17 
 
 		 608 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  39.47 
 
 		 1081 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  35.29 
 
 		 864 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  41.67 
 
 		 1141 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  42.11 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  36.72 
 
 		 916 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1027 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  40.5 
 
 		 1439 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  33.33 
 
 		 998 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.92 
 
 		 1095 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  50.57 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  46.84 
 
 		 826 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  48.84 
 
 		 1496 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  36.84 
 
 		 1096 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  36.84 
 
 		 827 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  38.54 
 
 		 4357 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  35.53 
 
 		 792 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  42.25 
 
 		 1222 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  47.13 
 
 		 1263 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 		 1272 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  47 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  37.93 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  41.25 
 
 		 1076 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  35.29 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.97 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  43.68 
 
 		 2178 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  39.47 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  40.54 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  39.77 
 
 		 2192 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1538 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1537 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1235  hypothetical protein  32.53 
 
 		 531 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  41.86 
 
 		 870 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 917 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  40.28 
 
 		 3027 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  41.43 
 
 		 839 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1390 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  44.44 
 
 		 2277 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>