165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2445 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  983    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  49.44 
 
 		 1096 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  48.01 
 
 		 1047 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  46.23 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  42.57 
 
 		 675 aa  289  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  39.41 
 
 		 1219 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  43.75 
 
 		 827 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  40.39 
 
 		 1141 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.94 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  39.68 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.78 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.25 
 
 		 612 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  45.11 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.6 
 
 		 626 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 626 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  38.52 
 
 		 916 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  40.66 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  32.64 
 
 		 549 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  36.1 
 
 		 1496 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  31.54 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  35.61 
 
 		 1146 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  54.35 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  34.19 
 
 		 1152 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  30.58 
 
 		 895 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  35.96 
 
 		 1285 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  30.71 
 
 		 777 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1406 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25 
 
 		 1332 aa  88.6  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  34.5 
 
 		 1127 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  34 
 
 		 1127 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1537 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1452 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.16 
 
 		 6885 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  29.08 
 
 		 2178 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  41.18 
 
 		 2002 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  30.35 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 		 1127 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.09 
 
 		 14944 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 		 1127 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  47 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  37.14 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 		 1224 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  38.73 
 
 		 846 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.05 
 
 		 4106 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.11 
 
 		 4761 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.84 
 
 		 1059 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  37.57 
 
 		 846 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.08 
 
 		 12684 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 1143 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  35.11 
 
 		 1054 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  36.36 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  34.1 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1538 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  32.22 
 
 		 3824 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  32.22 
 
 		 3739 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34.27 
 
 		 1031 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 1129 aa  67  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  37.57 
 
 		 1053 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  45.74 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.14 
 
 		 5216 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.67 
 
 		 3824 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.28 
 
 		 5743 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  42.55 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  22.66 
 
 		 1554 aa  64.3  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  40.82 
 
 		 2192 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  31.67 
 
 		 3721 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.6 
 
 		 3824 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.37 
 
 		 2117 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  39.76 
 
 		 663 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  27.78 
 
 		 1601 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  38.2 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  26.9 
 
 		 3516 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.37 
 
 		 3325 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.1 
 
 		 1919 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  34.18 
 
 		 3586 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  25.41 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  25.19 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 2704 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.4 
 
 		 1123 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1204 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.56 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  26.18 
 
 		 1529 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0680  hypothetical protein  25.25 
 
 		 510 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0251013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.25 
 
 		 5561 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.27 
 
 		 1362 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28 
 
 		 5561 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  31.45 
 
 		 892 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.72 
 
 		 1505 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.17 
 
 		 2911 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.17 
 
 		 3204 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.84 
 
 		 3822 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.47 
 
 		 899 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.71 
 
 		 14609 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.21 
 
 		 3925 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  24.81 
 
 		 892 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  42.47 
 
 		 1035 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>