146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002720 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  64.03 
 
 		 846 aa  1140    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  100 
 
 		 848 aa  1726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  70.33 
 
 		 846 aa  1243    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  84.91 
 
 		 846 aa  1504    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  68.22 
 
 		 543 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.72 
 
 		 1362 aa  234  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  37.44 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  40.61 
 
 		 360 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  40.61 
 
 		 360 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  40.61 
 
 		 360 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  40.3 
 
 		 360 aa  210  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 		 360 aa  203  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  40.91 
 
 		 360 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 551 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  40.61 
 
 		 360 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  40.18 
 
 		 360 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  40.3 
 
 		 360 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  32.63 
 
 		 1152 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.35 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  36.31 
 
 		 376 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.12 
 
 		 648 aa  177  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 1578 aa  170  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  39.29 
 
 		 1051 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  32.7 
 
 		 420 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.54 
 
 		 341 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  28.6 
 
 		 962 aa  160  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.61 
 
 		 1053 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  33.65 
 
 		 468 aa  156  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  31.83 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  36.72 
 
 		 1054 aa  145  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  34.19 
 
 		 1127 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  32.7 
 
 		 467 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  34.6 
 
 		 1127 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  32.81 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  32.72 
 
 		 1127 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  33.21 
 
 		 1127 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.45 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  33.21 
 
 		 1129 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  29.04 
 
 		 1285 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  29.39 
 
 		 565 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 471 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.35 
 
 		 782 aa  113  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 727 aa  111  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  27.16 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  34.67 
 
 		 1123 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  30.77 
 
 		 516 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  27.68 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.6 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.6 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.48 
 
 		 699 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.05 
 
 		 1146 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  42.42 
 
 		 174 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.07 
 
 		 1219 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1406 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.65 
 
 		 483 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  26.65 
 
 		 483 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  43.65 
 
 		 189 aa  101  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.68 
 
 		 703 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.37 
 
 		 551 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 484 aa  97.8  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  41.13 
 
 		 245 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.08 
 
 		 1096 aa  95.9  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  26.67 
 
 		 598 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  25.5 
 
 		 353 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.95 
 
 		 1057 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.93 
 
 		 1059 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.22 
 
 		 1047 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25 
 
 		 803 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1204 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  27.1 
 
 		 792 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  33.49 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 1224 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  34.74 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.49 
 
 		 1143 aa  73.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.76 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  49.09 
 
 		 1113 aa  71.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  36.51 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.19 
 
 		 984 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  34.1 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1452 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  44.19 
 
 		 1444 aa  67.4  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.25 
 
 		 12684 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  25.83 
 
 		 1113 aa  66.2  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.04 
 
 		 915 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.7 
 
 		 1132 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  25.29 
 
 		 14944 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  35 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.94 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.86 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  31.55 
 
 		 1204 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.09 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  36.19 
 
 		 1217 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.51 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  34.86 
 
 		 1474 aa  60.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.63 
 
 		 1585 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  40 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  26.86 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  42.99 
 
 		 1414 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  37.36 
 
 		 1247 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.32 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>