283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0936 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  59.68 
 
 		 894 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.22 
 
 		 984 aa  1083    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  60.89 
 
 		 1478 aa  797    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  64.98 
 
 		 854 aa  855    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  62.97 
 
 		 973 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  60.16 
 
 		 854 aa  810    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 979 aa  1986    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  61.74 
 
 		 900 aa  821    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  60.44 
 
 		 1121 aa  803    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  61.54 
 
 		 842 aa  824    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.3 
 
 		 938 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  54.65 
 
 		 741 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  58.71 
 
 		 966 aa  1107    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  60.89 
 
 		 1759 aa  796    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  60.25 
 
 		 722 aa  750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  59.11 
 
 		 974 aa  1095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60 
 
 		 919 aa  743    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  74.37 
 
 		 785 aa  1012    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  60.57 
 
 		 1904 aa  794    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  58.43 
 
 		 963 aa  1101    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56.4 
 
 		 767 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 589 aa  151  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  61.76 
 
 		 611 aa  142  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 		 620 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  59.43 
 
 		 1152 aa  121  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.31 
 
 		 491 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  60.58 
 
 		 775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.86 
 
 		 998 aa  119  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  49.22 
 
 		 488 aa  118  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  53.51 
 
 		 880 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  61.22 
 
 		 1362 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  50.44 
 
 		 743 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  44.37 
 
 		 669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.65 
 
 		 479 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  49.11 
 
 		 875 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  52.34 
 
 		 744 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  53.47 
 
 		 393 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 533 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  50.43 
 
 		 727 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.95 
 
 		 499 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  47.86 
 
 		 605 aa  109  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 		 1128 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.85 
 
 		 469 aa  108  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  53.77 
 
 		 495 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.96 
 
 		 934 aa  107  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  53.4 
 
 		 690 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  52.43 
 
 		 990 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  51.85 
 
 		 746 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.45 
 
 		 588 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.21 
 
 		 590 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  52.48 
 
 		 597 aa  105  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  55.45 
 
 		 459 aa  104  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 		 623 aa  104  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  52.94 
 
 		 376 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.71 
 
 		 773 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  50 
 
 		 1406 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  50 
 
 		 1007 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  48.51 
 
 		 1055 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  38.93 
 
 		 596 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  53.92 
 
 		 494 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.51 
 
 		 681 aa  102  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.13 
 
 		 703 aa  100  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 489 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.98 
 
 		 646 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  51.96 
 
 		 778 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  45.38 
 
 		 525 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.98 
 
 		 688 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  45.1 
 
 		 609 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  51.96 
 
 		 580 aa  98.6  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 518 aa  97.8  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  49.02 
 
 		 423 aa  97.8  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  48.51 
 
 		 436 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  54.08 
 
 		 778 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  59.34 
 
 		 938 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 719 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  41.48 
 
 		 439 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  49.02 
 
 		 812 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  41.5 
 
 		 633 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  45.38 
 
 		 485 aa  95.1  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  45.37 
 
 		 699 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.54 
 
 		 486 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 488 aa  94  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  41.59 
 
 		 455 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.86 
 
 		 794 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 1132 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  47.06 
 
 		 442 aa  92  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.66 
 
 		 925 aa  91.3  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.12 
 
 		 774 aa  91.3  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  44.86 
 
 		 864 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  58.02 
 
 		 1414 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.54 
 
 		 1059 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  43.93 
 
 		 894 aa  89  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  46.3 
 
 		 679 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  39.35 
 
 		 587 aa  88.6  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  49.45 
 
 		 598 aa  88.2  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  43.1 
 
 		 420 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.59 
 
 		 915 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.96 
 
 		 474 aa  87.8  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  40.58 
 
 		 1054 aa  87.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>