213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3718 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  100 
 
 		 525 aa  1058    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  59.53 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 362 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.2 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  47.2 
 
 		 963 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  49.26 
 
 		 966 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  32.59 
 
 		 1194 aa  124  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.55 
 
 		 1128 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.81 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 854 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.36 
 
 		 767 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.45 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.96 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  51.92 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  42.38 
 
 		 605 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.45 
 
 		 979 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.97 
 
 		 842 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.83 
 
 		 984 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47.06 
 
 		 596 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  55.32 
 
 		 938 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 812 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.34 
 
 		 609 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.22 
 
 		 875 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  49.49 
 
 		 1007 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  30.92 
 
 		 681 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  47.52 
 
 		 487 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.53 
 
 		 998 aa  93.6  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.14 
 
 		 469 aa  93.6  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.37 
 
 		 491 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.15 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  47.06 
 
 		 894 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 846 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  30.3 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  40.57 
 
 		 746 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  39.71 
 
 		 669 aa  90.1  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.59 
 
 		 785 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.53 
 
 		 880 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  41.32 
 
 		 974 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.57 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.57 
 
 		 628 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  38.36 
 
 		 488 aa  87.8  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 727 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  45.61 
 
 		 420 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.98 
 
 		 743 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  37.74 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  38.94 
 
 		 743 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40.78 
 
 		 990 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 		 620 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  40.78 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  33.12 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36 
 
 		 1055 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.59 
 
 		 778 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 913 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.28 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.42 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  41.44 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  44.79 
 
 		 403 aa  80.1  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  40.38 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  44.25 
 
 		 829 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  27.59 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.2 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.2 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 719 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  40 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 774 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  34.29 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 1209 aa  78.2  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.58 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  45.1 
 
 		 942 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.65 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  41 
 
 		 597 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  39.25 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41.58 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 679 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.62 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  37.86 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  39.6 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  36.75 
 
 		 694 aa  73.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.62 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  40.18 
 
 		 925 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  32.58 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  38.61 
 
 		 489 aa  72  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.82 
 
 		 717 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  39.6 
 
 		 376 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  41 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  35.64 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  37.62 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  35.48 
 
 		 864 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  37.38 
 
 		 851 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  36.43 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  35 
 
 		 740 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  22.16 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  38.89 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>