246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3105 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.88 
 
 		 984 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  66.13 
 
 		 842 aa  961    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  59.04 
 
 		 785 aa  783    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  56.66 
 
 		 1759 aa  732    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  56.35 
 
 		 1904 aa  731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  62.79 
 
 		 1121 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  58.4 
 
 		 973 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.53 
 
 		 938 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  50.71 
 
 		 741 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  58.35 
 
 		 966 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.52 
 
 		 722 aa  702    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.16 
 
 		 979 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  58.82 
 
 		 963 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  55.43 
 
 		 854 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  54.19 
 
 		 894 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  55.27 
 
 		 974 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  55.85 
 
 		 900 aa  906    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  56.66 
 
 		 1478 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.36 
 
 		 919 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 854 aa  1741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  98.15 
 
 		 690 aa  220  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  95.37 
 
 		 646 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.2 
 
 		 846 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  61.17 
 
 		 990 aa  131  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  55.77 
 
 		 597 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  35.37 
 
 		 609 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.01 
 
 		 942 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.89 
 
 		 623 aa  113  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  55.88 
 
 		 767 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  51.85 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.51 
 
 		 812 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  53.4 
 
 		 589 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50.47 
 
 		 880 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  53.4 
 
 		 620 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49.02 
 
 		 596 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  53.57 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.27 
 
 		 998 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.46 
 
 		 469 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  46.79 
 
 		 875 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50 
 
 		 420 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  49.07 
 
 		 913 aa  98.2  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  47.57 
 
 		 432 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  49.11 
 
 		 605 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.96 
 
 		 669 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 746 aa  95.9  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.28 
 
 		 580 aa  95.5  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  47.62 
 
 		 488 aa  95.1  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  45.19 
 
 		 934 aa  94  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 		 491 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.1 
 
 		 588 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.65 
 
 		 694 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  44.66 
 
 		 611 aa  91.3  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 774 aa  90.9  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 719 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  41.88 
 
 		 681 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  40.78 
 
 		 1055 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 439 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  44.66 
 
 		 442 aa  90.1  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.58 
 
 		 590 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 1128 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.57 
 
 		 459 aa  86.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  43.81 
 
 		 436 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  45.1 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  45.63 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  39.55 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.19 
 
 		 429 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.34 
 
 		 727 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  43.33 
 
 		 1007 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  44.23 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  42.72 
 
 		 744 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 938 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  41.18 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.52 
 
 		 829 aa  82.4  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.27 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  39.02 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.57 
 
 		 491 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  45.65 
 
 		 725 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.23 
 
 		 688 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  43.81 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.72 
 
 		 847 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.72 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  40.2 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  40.38 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  38.46 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  45.19 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  45.31 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.4 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  40.78 
 
 		 633 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  43.27 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  45.71 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  32.05 
 
 		 792 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.51 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  56.14 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  38.32 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  42.06 
 
 		 851 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>