More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6974 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  100 
 
 		 938 aa  1847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  68.47 
 
 		 1007 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  38.44 
 
 		 1172 aa  343  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.75 
 
 		 743 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  53.33 
 
 		 727 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.69 
 
 		 880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.1 
 
 		 998 aa  144  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.47 
 
 		 973 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.11 
 
 		 681 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 679 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  59.41 
 
 		 775 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.85 
 
 		 984 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.57 
 
 		 543 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  41.21 
 
 		 978 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  27.55 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  41.24 
 
 		 608 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  37.93 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  42.23 
 
 		 429 aa  111  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  41.78 
 
 		 719 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.68 
 
 		 847 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  49.58 
 
 		 533 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  48.8 
 
 		 688 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  48.33 
 
 		 963 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  55.21 
 
 		 778 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  37.75 
 
 		 762 aa  108  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  55.79 
 
 		 494 aa  108  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 658 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.13 
 
 		 637 aa  107  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  57.29 
 
 		 393 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  55.91 
 
 		 966 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  50.47 
 
 		 436 aa  105  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  58.43 
 
 		 1209 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.5 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  54.95 
 
 		 376 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.28 
 
 		 767 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  37.04 
 
 		 460 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.61 
 
 		 518 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  54.84 
 
 		 763 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  45.92 
 
 		 491 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  36.06 
 
 		 1137 aa  100  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  50.43 
 
 		 525 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  45.69 
 
 		 854 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  49.14 
 
 		 1128 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.58 
 
 		 979 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  52.53 
 
 		 596 aa  99.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  48.18 
 
 		 620 aa  99.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.57 
 
 		 925 aa  98.6  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  45 
 
 		 364 aa  98.6  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  30.17 
 
 		 385 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.6 
 
 		 479 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.9 
 
 		 785 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  51.61 
 
 		 403 aa  96.3  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.12 
 
 		 729 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 489 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  44.34 
 
 		 609 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.7 
 
 		 633 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.71 
 
 		 990 aa  95.5  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 		 1121 aa  95.5  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.9 
 
 		 809 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.45 
 
 		 875 aa  95.1  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  51.02 
 
 		 894 aa  95.1  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.44 
 
 		 588 aa  95.1  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.65 
 
 		 854 aa  94.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  49.02 
 
 		 794 aa  95.1  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 628 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  34.18 
 
 		 438 aa  94.7  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  46.73 
 
 		 589 aa  94.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  49.46 
 
 		 598 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 913 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 		 562 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  54.02 
 
 		 1298 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.22 
 
 		 491 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.61 
 
 		 846 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.9 
 
 		 1004 aa  92  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  51.11 
 
 		 580 aa  91.7  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50.51 
 
 		 420 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  47.92 
 
 		 487 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  39.55 
 
 		 605 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46 
 
 		 934 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  47.78 
 
 		 623 aa  89.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.51 
 
 		 681 aa  89  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  45.37 
 
 		 773 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  47.78 
 
 		 842 aa  88.2  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.33 
 
 		 589 aa  88.2  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  42.42 
 
 		 906 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  36.68 
 
 		 2170 aa  87.8  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.3 
 
 		 474 aa  87.8  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.93 
 
 		 486 aa  87.8  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  44.55 
 
 		 487 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 746 aa  87.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.34 
 
 		 488 aa  87  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  44.9 
 
 		 842 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  48.42 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  38.1 
 
 		 669 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  41.13 
 
 		 743 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  47.92 
 
 		 935 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.12 
 
 		 851 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  45.92 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.12 
 
 		 812 aa  84.7  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>