78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4436 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  100 
 
 
1172 aa  2388    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  38.44 
 
 
938 aa  335  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  25.36 
 
 
612 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  23.29 
 
 
589 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  22.05 
 
 
737 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  20.7 
 
 
450 aa  81.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  24.48 
 
 
583 aa  79.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4432  hypothetical protein  26.46 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  28.78 
 
 
1259 aa  75.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0930  hypothetical protein  27.2 
 
 
479 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0149624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  22.48 
 
 
850 aa  71.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  23.42 
 
 
587 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  23.87 
 
 
411 aa  70.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  20.79 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.45 
 
 
472 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  24.16 
 
 
535 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  21.99 
 
 
604 aa  66.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  23.98 
 
 
441 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  22.31 
 
 
446 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  21.96 
 
 
433 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  23.28 
 
 
471 aa  63.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.07 
 
 
491 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  32.45 
 
 
487 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  21.46 
 
 
399 aa  62.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  22.54 
 
 
658 aa  62  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.81 
 
 
425 aa  61.6  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  20.99 
 
 
568 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  22.4 
 
 
442 aa  60.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  23.48 
 
 
453 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  32.03 
 
 
412 aa  59.3  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.22 
 
 
677 aa  58.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30 
 
 
514 aa  57  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  24.69 
 
 
558 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  21.18 
 
 
445 aa  56.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.31 
 
 
503 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.93 
 
 
789 aa  55.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  21.83 
 
 
535 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  28.87 
 
 
392 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  21.21 
 
 
403 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  28.21 
 
 
483 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  19.66 
 
 
640 aa  52.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  29.13 
 
 
436 aa  52  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.21 
 
 
1139 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29 
 
 
756 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.96 
 
 
2073 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 
691 aa  51.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  23.4 
 
 
474 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  21.21 
 
 
824 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  25.53 
 
 
541 aa  50.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  20.22 
 
 
567 aa  50.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.73 
 
 
507 aa  50.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  25.55 
 
 
408 aa  49.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.41 
 
 
507 aa  49.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  25 
 
 
693 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  19.79 
 
 
445 aa  48.9  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.56 
 
 
507 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  37.7 
 
 
411 aa  48.5  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  28.37 
 
 
560 aa  48.5  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  32.26 
 
 
571 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  30.69 
 
 
569 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  26.83 
 
 
1215 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  27.01 
 
 
897 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30.59 
 
 
957 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.93 
 
 
537 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  31.68 
 
 
401 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  20.62 
 
 
408 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.53 
 
 
520 aa  46.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  32.88 
 
 
563 aa  46.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  22.44 
 
 
547 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  20.8 
 
 
533 aa  46.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  32.88 
 
 
461 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  22.09 
 
 
407 aa  46.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  25.71 
 
 
582 aa  45.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.13 
 
 
507 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  30.26 
 
 
461 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  29.36 
 
 
672 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.73 
 
 
503 aa  44.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  23.9 
 
 
487 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>