245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2136 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1128 aa  2271    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  46.42 
 
 
596 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  56.71 
 
 
655 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  54.94 
 
 
767 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  55.97 
 
 
791 aa  473  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  56.19 
 
 
611 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  53.35 
 
 
548 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  52.5 
 
 
572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.22 
 
 
623 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  53.65 
 
 
1209 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.28 
 
 
633 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.09 
 
 
646 aa  433  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.43 
 
 
639 aa  426  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  47.6 
 
 
628 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  50.93 
 
 
743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  48.76 
 
 
589 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.59 
 
 
452 aa  393  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  39.97 
 
 
605 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.85 
 
 
620 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.85 
 
 
590 aa  373  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.94 
 
 
588 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  35.1 
 
 
393 aa  214  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  53.3 
 
 
854 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  34.35 
 
 
450 aa  188  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  53.46 
 
 
842 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  49.73 
 
 
633 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  60.71 
 
 
846 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  57.55 
 
 
609 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  55.14 
 
 
812 aa  131  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.28 
 
 
455 aa  131  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 
984 aa  127  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.62 
 
 
773 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  42.04 
 
 
963 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  45.93 
 
 
966 aa  121  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40.54 
 
 
486 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  52.94 
 
 
894 aa  115  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50.98 
 
 
913 aa  111  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.14 
 
 
743 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  50 
 
 
525 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 
1042 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  40.62 
 
 
488 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  49.53 
 
 
628 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  45.71 
 
 
495 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  47.22 
 
 
533 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.13 
 
 
979 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  48.51 
 
 
543 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.79 
 
 
459 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.79 
 
 
479 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  49.04 
 
 
775 aa  100  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.48 
 
 
491 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.23 
 
 
469 aa  99.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.74 
 
 
420 aa  99.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.52 
 
 
494 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  28.18 
 
 
469 aa  98.6  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  54.26 
 
 
938 aa  98.6  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  39.67 
 
 
785 aa  95.9  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  46.09 
 
 
694 aa  95.9  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.75 
 
 
499 aa  94.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.12 
 
 
746 aa  94.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  35.78 
 
 
1055 aa  94.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  44.66 
 
 
774 aa  94.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  47.06 
 
 
727 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  43.56 
 
 
688 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.27 
 
 
681 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  44.55 
 
 
436 aa  93.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  26.2 
 
 
501 aa  92.8  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  45.54 
 
 
1007 aa  93.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 
925 aa  92.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.99 
 
 
669 aa  91.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.58 
 
 
518 aa  91.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.12 
 
 
934 aa  90.9  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  27.01 
 
 
419 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  41.75 
 
 
990 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.59 
 
 
778 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.66 
 
 
851 aa  89  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 
364 aa  88.6  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.94 
 
 
875 aa  88.6  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  39.29 
 
 
974 aa  88.6  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.5 
 
 
366 aa  87.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  46.24 
 
 
403 aa  87.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.69 
 
 
690 aa  87.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  40.78 
 
 
906 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.69 
 
 
794 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  41.18 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.56 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.48 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.34 
 
 
998 aa  85.5  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  42.16 
 
 
842 aa  85.5  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  44.34 
 
 
864 aa  85.1  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  43.69 
 
 
854 aa  85.1  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  46.24 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 
942 aa  85.1  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  44.12 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.1 
 
 
744 aa  84.7  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  40.59 
 
 
487 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  48.21 
 
 
829 aa  84.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  35.66 
 
 
371 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  46.24 
 
 
763 aa  84.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  44.05 
 
 
456 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.67 
 
 
485 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>