More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1830 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 543 aa  1081    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  58.71 
 
 		 523 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  62.01 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  57.94 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  55.79 
 
 		 449 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  54.85 
 
 		 445 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  51.22 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  54.64 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  52.85 
 
 		 1294 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  52.85 
 
 		 1414 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  52.85 
 
 		 1369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.01 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  45.83 
 
 		 403 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  63.16 
 
 		 681 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  54.69 
 
 		 727 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  49.49 
 
 		 978 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.91 
 
 		 847 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.23 
 
 		 998 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.61 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  47 
 
 		 658 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.55 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  28.48 
 
 		 558 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  36.39 
 
 		 608 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  43.89 
 
 		 743 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.25 
 
 		 732 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.46 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  47.22 
 
 		 543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.93 
 
 		 1007 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.75 
 
 		 637 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  37.62 
 
 		 699 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  43.07 
 
 		 938 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  51.89 
 
 		 913 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  41.21 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  45.08 
 
 		 973 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.33 
 
 		 649 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 1128 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.5 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.22 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50 
 
 		 393 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.04 
 
 		 778 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.52 
 
 		 773 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  48.51 
 
 		 596 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.16 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  47.57 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 743 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  44.64 
 
 		 488 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.06 
 
 		 518 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  48.6 
 
 		 851 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 688 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  44.23 
 
 		 436 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  37.8 
 
 		 655 aa  97.8  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 854 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  48.51 
 
 		 974 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45.54 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  49.02 
 
 		 774 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.6 
 
 		 846 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.6 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 		 633 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.44 
 
 		 1121 aa  95.1  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  45.54 
 
 		 842 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.2 
 
 		 984 aa  94.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  41.01 
 
 		 719 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.19 
 
 		 925 aa  94.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  44.23 
 
 		 623 aa  93.6  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 906 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  38.5 
 
 		 900 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.35 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  34.52 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  40.59 
 
 		 455 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.43 
 
 		 674 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.06 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.84 
 
 		 609 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  45 
 
 		 1055 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.51 
 
 		 674 aa  92  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.43 
 
 		 674 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  44.23 
 
 		 842 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.05 
 
 		 674 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.35 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.97 
 
 		 674 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.53 
 
 		 491 aa  90.9  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 1137 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  48.45 
 
 		 485 aa  90.5  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.27 
 
 		 448 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.43 
 
 		 674 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.43 
 
 		 674 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.43 
 
 		 674 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.43 
 
 		 674 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.6 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.89 
 
 		 674 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  50.47 
 
 		 829 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 812 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  39.62 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 360 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.14 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  41.38 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40.78 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  43.27 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  24.57 
 
 		 850 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>