235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0900 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  100 
 
 
453 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  64.21 
 
 
460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  55.68 
 
 
468 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  53.49 
 
 
449 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  55.98 
 
 
478 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  50.87 
 
 
445 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  61.58 
 
 
523 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  58.7 
 
 
543 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  51.74 
 
 
403 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  50.93 
 
 
561 aa  343  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  50 
 
 
1414 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  50.31 
 
 
1294 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  55.84 
 
 
1369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.99 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  30.25 
 
 
558 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.45 
 
 
732 aa  140  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  55.56 
 
 
702 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  54.37 
 
 
447 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  54.08 
 
 
477 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  51.61 
 
 
451 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.38 
 
 
437 aa  96.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  42.22 
 
 
756 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  48.04 
 
 
673 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  51.04 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.96 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  51.11 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  52.13 
 
 
820 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  49.47 
 
 
349 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 
846 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  46.08 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  48.48 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.51 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  51.52 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  48 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  48.98 
 
 
900 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.34 
 
 
658 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.58 
 
 
609 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  47.42 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  40.82 
 
 
925 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  45.74 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  47.31 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  48.96 
 
 
655 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  51.58 
 
 
454 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.22 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  39.39 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  48.94 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  49.48 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  42.45 
 
 
694 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  48.86 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  47.42 
 
 
763 aa  77  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.42 
 
 
1209 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  43.62 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  32.1 
 
 
792 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.46 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  43.75 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  22.31 
 
 
850 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  26.04 
 
 
600 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.3 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  47.19 
 
 
89 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43 
 
 
847 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.69 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  47 
 
 
403 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  39.8 
 
 
743 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  45.65 
 
 
851 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 
562 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  40 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  52.22 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.24 
 
 
984 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  42.27 
 
 
773 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  46.32 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  48.31 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 
678 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  39.39 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  35.51 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  45.05 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  41.11 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41.84 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 
842 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  36.78 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  37.5 
 
 
854 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  42.17 
 
 
1042 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.58 
 
 
998 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  46.32 
 
 
656 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 
1137 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  43.81 
 
 
911 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  40.62 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.45 
 
 
1121 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  48.75 
 
 
1298 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.18 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  50 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  36.45 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  41.84 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  38.68 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.18 
 
 
494 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  38.53 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.05 
 
 
646 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  38.64 
 
 
864 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  39.8 
 
 
744 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42 
 
 
727 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>