More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0934 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  100 
 
 		 523 aa  1053    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  59.24 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  72.64 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  65.81 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  62.87 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  58.77 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  59.8 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  54.52 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  52.12 
 
 		 468 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  49.85 
 
 		 403 aa  319  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.25 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  49.51 
 
 		 1294 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  49.51 
 
 		 1414 aa  299  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  91.62 
 
 		 543 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  53.61 
 
 		 1369 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  53.12 
 
 		 847 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.26 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  49.55 
 
 		 978 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.94 
 
 		 998 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  47.64 
 
 		 900 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  45.5 
 
 		 655 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  29.88 
 
 		 649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.22 
 
 		 880 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 658 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  27.44 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  43.52 
 
 		 608 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  44.9 
 
 		 681 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  39.66 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.23 
 
 		 743 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 727 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.27 
 
 		 674 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.27 
 
 		 674 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  35.07 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  35.07 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  35.07 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  35.07 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  34.6 
 
 		 674 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  39.09 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 674 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  34.31 
 
 		 674 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  38.12 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.65 
 
 		 674 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  38.74 
 
 		 973 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  58.62 
 
 		 702 aa  93.6  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 699 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.81 
 
 		 637 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  52.43 
 
 		 673 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 		 674 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  48.51 
 
 		 1154 aa  84.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.92 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  28.51 
 
 		 850 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  45 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  35.98 
 
 		 679 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 1137 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1213 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.11 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.33 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  41.57 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 		 1121 aa  77.8  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  52.94 
 
 		 924 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  44.57 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35 
 
 		 1007 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  49.38 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.42 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  49.43 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 913 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  40.22 
 
 		 925 aa  73.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  44.68 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  43.9 
 
 		 854 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  44.21 
 
 		 349 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  45.83 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  41.3 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  35.64 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  45.65 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  35.54 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  45.98 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  35.66 
 
 		 875 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  44.79 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.76 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  38.04 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  43 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.49 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  54.26 
 
 		 1017 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  45.36 
 
 		 2170 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 842 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.36 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  40.17 
 
 		 1887 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  40.21 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  41.76 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  34.1 
 
 		 719 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  41.11 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.78 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>