218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5296 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  34.6 
 
 		 743 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.56 
 
 		 998 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  37.06 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.33 
 
 		 637 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  36.36 
 
 		 847 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  35.35 
 
 		 973 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  33.5 
 
 		 727 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  35.38 
 
 		 681 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  35.53 
 
 		 543 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  39.6 
 
 		 611 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  33.67 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  34.53 
 
 		 880 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.07 
 
 		 729 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  29.73 
 
 		 938 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  29.11 
 
 		 1007 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  32.4 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.51 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  34.84 
 
 		 978 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.63 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.63 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  26.58 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.46 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  33.66 
 
 		 608 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.4 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  40 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.27 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.56 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.26 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.02 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.22 
 
 		 767 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  27.64 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40.95 
 
 		 990 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 1137 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 589 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  38.68 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.46 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.66 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  38.83 
 
 		 775 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  38.83 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  37.84 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  35.58 
 
 		 875 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  27.95 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  27.95 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  37.86 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.57 
 
 		 773 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  38.68 
 
 		 842 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.42 
 
 		 913 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  34.9 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  36.54 
 
 		 934 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.52 
 
 		 6885 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  37.62 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  36.27 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  33.91 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  33.65 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  29.32 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  33.65 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 		 963 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.01 
 
 		 2170 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  36.54 
 
 		 580 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  37.38 
 
 		 690 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  37.38 
 
 		 854 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  35.58 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  34.58 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  41.75 
 
 		 851 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  32.79 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.45 
 
 		 646 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.78 
 
 		 1448 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 966 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  33.33 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.98 
 
 		 778 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  34.55 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  32.76 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  35.92 
 
 		 688 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  34.29 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  32.5 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  37.86 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.24 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  35.24 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  33.01 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 		 658 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  35.92 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.63 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  33.33 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  35.29 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  35.64 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  33.98 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  31.37 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  34.58 
 
 		 744 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  25.81 
 
 		 674 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.29 
 
 		 746 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>