298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0294 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  70.82 
 
 
511 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
609 aa  1233    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  57.87 
 
 
846 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  33.03 
 
 
460 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
477 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  61.64 
 
 
812 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  30 
 
 
465 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  61.32 
 
 
854 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  57.55 
 
 
1128 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.14 
 
 
1152 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  50.57 
 
 
942 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  55.96 
 
 
628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  60.4 
 
 
588 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  57.43 
 
 
590 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 
633 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  47.34 
 
 
694 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  52 
 
 
842 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  53.92 
 
 
596 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.24 
 
 
984 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  49.55 
 
 
486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.58 
 
 
773 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  51.46 
 
 
488 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  48.51 
 
 
894 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.79 
 
 
913 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  46.43 
 
 
963 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.94 
 
 
794 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  48.51 
 
 
743 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  50.44 
 
 
455 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50 
 
 
494 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  53.47 
 
 
436 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.06 
 
 
469 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.46 
 
 
499 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 
1042 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  49 
 
 
966 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  26.54 
 
 
543 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  49.5 
 
 
533 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 
778 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25.75 
 
 
1223 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  49.04 
 
 
623 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  44.12 
 
 
1055 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.06 
 
 
518 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  45.54 
 
 
774 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.06 
 
 
688 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.62 
 
 
775 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  44.04 
 
 
420 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.17 
 
 
479 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  48.57 
 
 
925 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  48.54 
 
 
934 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  49.04 
 
 
842 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.75 
 
 
746 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.81 
 
 
767 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  44.55 
 
 
459 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.1 
 
 
979 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  54.55 
 
 
460 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  37.69 
 
 
681 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 
620 aa  97.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 
589 aa  97.8  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.83 
 
 
743 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  48.54 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  42.34 
 
 
525 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.15 
 
 
393 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  37.74 
 
 
495 aa  94.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.86 
 
 
605 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.93 
 
 
491 aa  94  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  46.67 
 
 
935 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  46.88 
 
 
485 aa  94  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  45.54 
 
 
389 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.37 
 
 
633 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 
894 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  48.94 
 
 
938 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.69 
 
 
727 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.95 
 
 
690 aa  92  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  40 
 
 
489 aa  92  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.81 
 
 
847 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  48.91 
 
 
608 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  40.2 
 
 
851 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  39.6 
 
 
974 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.24 
 
 
1209 aa  91.3  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  46.74 
 
 
403 aa  90.5  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.44 
 
 
785 aa  90.5  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.95 
 
 
646 aa  90.5  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.61 
 
 
744 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  40.95 
 
 
854 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.7 
 
 
474 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.68 
 
 
580 aa  89.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  38.84 
 
 
543 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  34.72 
 
 
371 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  36.89 
 
 
906 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
562 aa  89.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  39.66 
 
 
1007 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  38.1 
 
 
990 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  43.81 
 
 
438 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  42.57 
 
 
487 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  38.05 
 
 
669 aa  87.8  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.17 
 
 
2690 aa  87.4  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  41.9 
 
 
880 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  37.74 
 
 
681 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  44.09 
 
 
763 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  41.58 
 
 
740 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.98 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>