276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0016 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  54.45 
 
 		 794 aa  685    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  70.38 
 
 		 880 aa  892    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 990 aa  2008    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  54.33 
 
 		 1137 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  54.19 
 
 		 1017 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  59.29 
 
 		 846 aa  796    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  56.47 
 
 		 847 aa  819    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.7 
 
 		 887 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  48.14 
 
 		 739 aa  582  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.42 
 
 		 985 aa  581  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  48.93 
 
 		 1759 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  48.12 
 
 		 736 aa  561  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  47.54 
 
 		 710 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  47.81 
 
 		 725 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 730 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  44.95 
 
 		 737 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  44.8 
 
 		 1369 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  42.07 
 
 		 742 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  41.68 
 
 		 715 aa  439  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 		 707 aa  363  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  36.7 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 928 aa  322  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 961 aa  320  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  34.38 
 
 		 757 aa  318  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  39.1 
 
 		 526 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.24 
 
 		 984 aa  314  5.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 		 563 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  31.91 
 
 		 949 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  36.2 
 
 		 854 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 789 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 894 aa  278  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  30.09 
 
 		 778 aa  261  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 611 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  32.99 
 
 		 590 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.35 
 
 		 978 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.3 
 
 		 2042 aa  157  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  68.47 
 
 		 598 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  64.76 
 
 		 775 aa  138  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  60.38 
 
 		 690 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  60.38 
 
 		 854 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  59.43 
 
 		 646 aa  134  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.69 
 
 		 998 aa  124  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  55.88 
 
 		 623 aa  120  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  52.34 
 
 		 875 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  55.88 
 
 		 842 aa  119  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  53.47 
 
 		 597 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  52.88 
 
 		 489 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.92 
 
 		 934 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  53.33 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.96 
 
 		 767 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  49.04 
 
 		 580 aa  112  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 		 966 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  50 
 
 		 785 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.48 
 
 		 979 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.24 
 
 		 963 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  49.07 
 
 		 913 aa  105  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  44.36 
 
 		 589 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  54.29 
 
 		 719 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.23 
 
 		 609 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  45.45 
 
 		 596 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 488 aa  100  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  45.79 
 
 		 744 aa  99  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  42.21 
 
 		 679 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  46.67 
 
 		 487 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  43.56 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  51.49 
 
 		 774 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  45.54 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 746 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46 
 
 		 588 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  41.22 
 
 		 620 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  38.66 
 
 		 669 aa  95.9  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  47.57 
 
 		 488 aa  95.5  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.54 
 
 		 432 aa  95.1  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  44.14 
 
 		 436 aa  94.7  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.95 
 
 		 984 aa  94  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  42.2 
 
 		 1007 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.72 
 
 		 436 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  45.45 
 
 		 605 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.51 
 
 		 429 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 1128 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  45.71 
 
 		 727 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42.42 
 
 		 894 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  50.5 
 
 		 459 aa  92.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 743 aa  92  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  46.74 
 
 		 938 aa  92  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  42 
 
 		 1055 aa  91.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.43 
 
 		 590 aa  91.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 854 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.08 
 
 		 681 aa  91.3  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  42.72 
 
 		 491 aa  90.5  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 688 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 778 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  45.37 
 
 		 851 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40.3 
 
 		 486 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.48 
 
 		 438 aa  88.2  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.4 
 
 		 479 aa  88.6  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.54 
 
 		 469 aa  88.2  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 364 aa  88.2  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 974 aa  88.2  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>