290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2912 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  100 
 
 		 491 aa  989    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  66.4 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  62.32 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  55.8 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  48.29 
 
 		 870 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.7 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  45.36 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  44.19 
 
 		 341 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  47.1 
 
 		 330 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  44.56 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  46.05 
 
 		 329 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  46.05 
 
 		 329 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  46.05 
 
 		 329 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  44.62 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.86 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45.53 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  44.25 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  41.89 
 
 		 346 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.79 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.01 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  38.54 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  41.86 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  41.67 
 
 		 487 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  40.71 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  34.44 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  37.58 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  30.23 
 
 		 596 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  33.04 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  57.14 
 
 		 681 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.74 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  48.8 
 
 		 488 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  54.46 
 
 		 743 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  39.56 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  56.6 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  33.33 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  46.76 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  57.28 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  44.2 
 
 		 620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  56.31 
 
 		 774 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.35 
 
 		 767 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  48.57 
 
 		 669 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  50 
 
 		 744 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.68 
 
 		 979 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  54.72 
 
 		 746 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.75 
 
 		 984 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  35.32 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  31.15 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.5 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  35.46 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.72 
 
 		 785 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  50.89 
 
 		 974 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  33.17 
 
 		 773 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 1128 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 842 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  44.25 
 
 		 1055 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.03 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.62 
 
 		 913 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  51.04 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  43.08 
 
 		 963 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.44 
 
 		 998 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  53.27 
 
 		 719 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 854 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  43.18 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  52.43 
 
 		 880 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  45 
 
 		 847 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  48.54 
 
 		 611 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 966 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.67 
 
 		 588 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  57.14 
 
 		 829 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.95 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.63 
 
 		 846 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.98 
 
 		 646 aa  97.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.57 
 
 		 609 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.9 
 
 		 812 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  43.18 
 
 		 1042 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  50.49 
 
 		 854 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  49.51 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  38.64 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  49.53 
 
 		 775 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  55.81 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 934 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.44 
 
 		 633 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  44.92 
 
 		 525 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  44.55 
 
 		 623 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 906 aa  93.2  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.28 
 
 		 925 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.14 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.31 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  44.55 
 
 		 842 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  36.14 
 
 		 501 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  45.87 
 
 		 942 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  28.42 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  45.97 
 
 		 978 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 543 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>