224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3301 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  100 
 
 		 485 aa  993    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.68 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  41.6 
 
 		 829 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  44.69 
 
 		 1195 aa  272  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.6 
 
 		 1221 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  43.71 
 
 		 308 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.96 
 
 		 507 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  40.88 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.31 
 
 		 474 aa  213  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.94 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  40.44 
 
 		 325 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  35.14 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  35.14 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  63.3 
 
 		 743 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  53.38 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.94 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  51.54 
 
 		 744 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  60.19 
 
 		 774 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.41 
 
 		 499 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  47.73 
 
 		 669 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  46.21 
 
 		 605 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.38 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.35 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  48.39 
 
 		 785 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  51.89 
 
 		 746 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  55.34 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  46.38 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  51.35 
 
 		 773 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.68 
 
 		 491 aa  113  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.97 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  57.43 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  51.89 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.39 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.58 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  44.93 
 
 		 767 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.52 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50 
 
 		 913 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 		 979 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  51.49 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.22 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  34.47 
 
 		 963 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  45.45 
 
 		 609 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.27 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 633 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  53.47 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.14 
 
 		 846 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42.02 
 
 		 842 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  47.06 
 
 		 974 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 		 966 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 		 854 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 		 1128 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.63 
 
 		 628 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  48.54 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.61 
 
 		 984 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  47.17 
 
 		 990 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  46.08 
 
 		 925 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  53.61 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 934 aa  96.7  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  46.73 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  45.63 
 
 		 611 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 688 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  45.1 
 
 		 518 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  48.51 
 
 		 543 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48.04 
 
 		 494 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 		 812 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  49.45 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 778 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 681 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  45.19 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.43 
 
 		 942 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  43.4 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  43.24 
 
 		 794 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  40 
 
 		 1055 aa  90.9  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.85 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  45 
 
 		 673 aa  90.1  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 366 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  44.55 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.89 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  44.12 
 
 		 623 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  44.12 
 
 		 851 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  46.73 
 
 		 894 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42.16 
 
 		 894 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  44.12 
 
 		 842 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  45.28 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  38.18 
 
 		 1042 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 740 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.45 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.23 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  44.44 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.67 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.35 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  49.46 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  46.94 
 
 		 938 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 935 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  51.22 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  48.39 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  41 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.1 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.84 
 
 		 875 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>