219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1240 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  93.12 
 
 		 536 aa  1025    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 780 aa  1611    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  71.43 
 
 		 746 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  72.86 
 
 		 541 aa  310  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  63.35 
 
 		 1122 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  66.99 
 
 		 604 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  60.93 
 
 		 1015 aa  270  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  65.57 
 
 		 1164 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  63.23 
 
 		 629 aa  249  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  53.56 
 
 		 490 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  54.59 
 
 		 965 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  42.28 
 
 		 928 aa  225  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  46.44 
 
 		 501 aa  224  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  52.88 
 
 		 951 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  39 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  49.76 
 
 		 524 aa  190  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  51.49 
 
 		 535 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  40.62 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 837 aa  178  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  36.39 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  44.98 
 
 		 679 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  47 
 
 		 533 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  38.67 
 
 		 1585 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 683 aa  159  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  35.08 
 
 		 1195 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.47 
 
 		 1221 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  42.59 
 
 		 630 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.25 
 
 		 1414 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  52.21 
 
 		 912 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  38.82 
 
 		 560 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1418  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  37.5 
 
 		 284 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0892539  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.66 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  34.15 
 
 		 492 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  45.97 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  31.48 
 
 		 308 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  46.92 
 
 		 618 aa  120  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.2 
 
 		 829 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.46 
 
 		 474 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2555  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  37.14 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880484  normal  0.133865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  32.87 
 
 		 488 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.2 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  40.14 
 
 		 1290 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  31.53 
 
 		 325 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3849  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.61 
 
 		 276 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  37.12 
 
 		 479 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  40.6 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  39.06 
 
 		 470 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  37.59 
 
 		 469 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  38.64 
 
 		 479 aa  89  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.4 
 
 		 945 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  35.86 
 
 		 1186 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.04 
 
 		 953 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3784  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.77 
 
 		 280 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0139497  normal  0.0146207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  52.94 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  34.59 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  41.67 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  33.09 
 
 		 630 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  50.67 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  48.48 
 
 		 477 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.48 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  49.32 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  46.94 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  52.24 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  35.77 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  45.71 
 
 		 955 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.83 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  57.38 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  42.86 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  45.45 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  50.7 
 
 		 949 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  31.72 
 
 		 577 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  41.1 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1596  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.39 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.91136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  54.39 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  52.46 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  34.07 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  44.78 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  49.3 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.25 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  35.05 
 
 		 558 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  45.45 
 
 		 311 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 961 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.29 
 
 		 884 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  44.59 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  47.06 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  42.47 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  43.55 
 
 		 534 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  43.66 
 
 		 1077 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  42.11 
 
 		 303 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  29.76 
 
 		 1132 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  48.39 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.03 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.56 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  38.37 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>