More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6890 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  72.97 
 
 		 611 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  100 
 
 		 767 aa  1553    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  65.5 
 
 		 596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  65.71 
 
 		 452 aa  568  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  62.15 
 
 		 589 aa  552  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  62.59 
 
 		 620 aa  548  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  62.21 
 
 		 590 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  62.26 
 
 		 588 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  59.08 
 
 		 605 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  56.07 
 
 		 655 aa  485  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  54.94 
 
 		 1128 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  56.15 
 
 		 646 aa  479  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  52.78 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  51.9 
 
 		 791 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  51.28 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  50.93 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.95 
 
 		 639 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  50.82 
 
 		 1209 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  46.15 
 
 		 628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.72 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  42.86 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.39 
 
 		 979 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  53.11 
 
 		 966 aa  303  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 963 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.67 
 
 		 984 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  48.03 
 
 		 974 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  35.88 
 
 		 393 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.01 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  62.5 
 
 		 785 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  62.14 
 
 		 775 aa  126  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  49.61 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.9 
 
 		 479 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.73 
 
 		 998 aa  118  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  56.44 
 
 		 880 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  44.52 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.35 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  60.55 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  55.88 
 
 		 690 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  47.83 
 
 		 727 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  53 
 
 		 875 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  55.88 
 
 		 854 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  51.96 
 
 		 990 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.55 
 
 		 743 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  44.62 
 
 		 854 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.92 
 
 		 469 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  47.24 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.24 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  37.87 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  54 
 
 		 393 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  49.53 
 
 		 744 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  47.24 
 
 		 1007 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.38 
 
 		 499 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  51.49 
 
 		 934 aa  104  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  51.49 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.51 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  48.11 
 
 		 746 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.02 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  37.14 
 
 		 455 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 688 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  49 
 
 		 597 aa  101  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50.5 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  49.5 
 
 		 518 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.57 
 
 		 420 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 812 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 938 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  43.81 
 
 		 609 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.51 
 
 		 423 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  50 
 
 		 485 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  42.28 
 
 		 525 aa  98.2  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  46.53 
 
 		 842 aa  97.8  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.51 
 
 		 778 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  44.55 
 
 		 894 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  48.54 
 
 		 774 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  53.57 
 
 		 829 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45 
 
 		 436 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  54.44 
 
 		 598 aa  94.7  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41 
 
 		 1055 aa  94  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  44.55 
 
 		 488 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  47.52 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  52.48 
 
 		 446 aa  92.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  44.86 
 
 		 719 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  42.26 
 
 		 1053 aa  89.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  44.55 
 
 		 442 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  29.53 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  43.81 
 
 		 628 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  27.23 
 
 		 469 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  43.56 
 
 		 487 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  45.63 
 
 		 851 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  39.06 
 
 		 842 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  38.29 
 
 		 1054 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.31 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.73 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 846 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.91 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 		 925 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  47.12 
 
 		 935 aa  84.7  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.32 
 
 		 1362 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.12 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>