231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0295 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  61.64 
 
 		 973 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  52.15 
 
 		 894 aa  837    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.16 
 
 		 984 aa  737    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  64.98 
 
 		 979 aa  861    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  59.6 
 
 		 1121 aa  764    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  64.87 
 
 		 785 aa  852    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  55.43 
 
 		 854 aa  742    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.06 
 
 		 938 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  57.77 
 
 		 741 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  61.47 
 
 		 966 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  57.7 
 
 		 974 aa  782    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  58.54 
 
 		 900 aa  773    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  61.62 
 
 		 963 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 854 aa  1743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.9 
 
 		 919 aa  779    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  61.21 
 
 		 842 aa  811    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  58.31 
 
 		 722 aa  749    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  62.04 
 
 		 1478 aa  832    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  62.04 
 
 		 1904 aa  829    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  64.96 
 
 		 1128 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  56.96 
 
 		 842 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 633 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  66.98 
 
 		 846 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  61.32 
 
 		 609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.11 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  41.01 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.75 
 
 		 588 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  51.82 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.52 
 
 		 773 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  53.47 
 
 		 628 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  55 
 
 		 596 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.67 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50.96 
 
 		 913 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.83 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  51.92 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  44.8 
 
 		 488 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.31 
 
 		 767 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.12 
 
 		 420 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  47.01 
 
 		 525 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 495 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.06 
 
 		 746 aa  101  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.71 
 
 		 459 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  49.15 
 
 		 727 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  49.51 
 
 		 934 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48.51 
 
 		 494 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 688 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  49.04 
 
 		 775 aa  99.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  46.36 
 
 		 1042 aa  97.8  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  44.79 
 
 		 1055 aa  97.8  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.83 
 
 		 743 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  48.51 
 
 		 518 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 774 aa  97.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47.57 
 
 		 925 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  49.02 
 
 		 623 aa  96.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.13 
 
 		 499 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  43 
 
 		 469 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 543 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  48.39 
 
 		 743 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 533 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  41.09 
 
 		 681 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  43.24 
 
 		 694 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  40.65 
 
 		 864 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  51.06 
 
 		 938 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.56 
 
 		 778 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 489 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.67 
 
 		 875 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 906 aa  92  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.19 
 
 		 580 aa  91.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.35 
 
 		 491 aa  91.3  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  44.25 
 
 		 1007 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.74 
 
 		 474 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.63 
 
 		 487 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.67 
 
 		 633 aa  90.9  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  46.88 
 
 		 562 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40.78 
 
 		 990 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  47.52 
 
 		 389 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 669 aa  88.6  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.75 
 
 		 847 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 620 aa  89  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  44 
 
 		 740 aa  88.2  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  46.81 
 
 		 1209 aa  88.6  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 366 aa  87.8  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.56 
 
 		 393 aa  87  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 935 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.65 
 
 		 448 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 589 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  39.06 
 
 		 371 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  47.31 
 
 		 763 aa  86.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  40.16 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  43.52 
 
 		 942 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46.07 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  42.71 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  39.45 
 
 		 794 aa  85.5  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 681 aa  84.7  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  44 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  32.12 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  41.28 
 
 		 851 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  45.16 
 
 		 403 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.35 
 
 		 998 aa  83.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  45.69 
 
 		 829 aa  83.2  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>