More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2509 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  100 
 
 		 489 aa  979    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.61 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.43 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  41.6 
 
 		 442 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  50.81 
 
 		 656 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  47.37 
 
 		 451 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50.34 
 
 		 422 aa  267  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  48.24 
 
 		 436 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  38.69 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  38.71 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  36.47 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  35.5 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  37.79 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  35.29 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  36.33 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  36.3 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  35.4 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  31.32 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.72 
 
 		 846 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.18 
 
 		 366 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  34.29 
 
 		 331 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  31.8 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.47 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  29.24 
 
 		 363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  56.19 
 
 		 775 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 		 998 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  31.5 
 
 		 368 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  55.45 
 
 		 934 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  43.11 
 
 		 942 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  28.77 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 794 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  57.01 
 
 		 690 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50.49 
 
 		 623 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  54.21 
 
 		 785 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50.49 
 
 		 842 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  50.47 
 
 		 875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  47.66 
 
 		 580 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  51.89 
 
 		 990 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  30.85 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.29 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  48.11 
 
 		 880 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 812 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51 
 
 		 596 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51 
 
 		 393 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  49.11 
 
 		 669 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 966 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  37.99 
 
 		 688 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  44.65 
 
 		 694 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  52.88 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.23 
 
 		 913 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.49 
 
 		 767 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  48.08 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  44.7 
 
 		 681 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.02 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  51.49 
 
 		 746 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  51.96 
 
 		 620 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  46.43 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 963 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  42.98 
 
 		 486 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  45.63 
 
 		 1055 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.81 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  47.17 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  44.23 
 
 		 487 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50 
 
 		 979 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.2 
 
 		 474 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  48.11 
 
 		 851 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  45.45 
 
 		 1007 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  28.62 
 
 		 342 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.1 
 
 		 778 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  47.54 
 
 		 681 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  50 
 
 		 743 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 854 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 588 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 906 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  44.95 
 
 		 773 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  52.94 
 
 		 774 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  46.28 
 
 		 597 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  45.28 
 
 		 376 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  44 
 
 		 590 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 628 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  47.31 
 
 		 938 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  46.08 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  49.02 
 
 		 605 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  30.8 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  30.8 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  47.06 
 
 		 611 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51.09 
 
 		 763 aa  93.6  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.18 
 
 		 984 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  46.53 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  43.52 
 
 		 864 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  50 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  48.04 
 
 		 974 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.22 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 		 1128 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.52 
 
 		 491 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  41.59 
 
 		 533 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 744 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>