291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6973 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  100 
 
 		 1007 aa  2026    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0757  dextranase  34.48 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  68.47 
 
 		 938 aa  350  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4431  hypothetical protein  32.65 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0929  hypothetical protein  31.1 
 
 		 579 aa  252  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.279315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0653  hypothetical protein  27.18 
 
 		 651 aa  173  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.293618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  52.55 
 
 		 727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.27 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.95 
 
 		 880 aa  144  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0759  hypothetical protein  22.86 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.58 
 
 		 998 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  35.43 
 
 		 679 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  49.4 
 
 		 1017 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  38.43 
 
 		 699 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  41.62 
 
 		 543 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  57.84 
 
 		 775 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  25.9 
 
 		 747 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  40.28 
 
 		 719 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  37.93 
 
 		 847 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  36.82 
 
 		 637 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.69 
 
 		 681 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  49.17 
 
 		 533 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  55.79 
 
 		 494 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40.49 
 
 		 429 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 423 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  37.11 
 
 		 608 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  57.14 
 
 		 767 aa  107  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  53.12 
 
 		 778 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  38.35 
 
 		 978 aa  106  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.59 
 
 		 688 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.58 
 
 		 984 aa  105  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.16 
 
 		 973 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.24 
 
 		 518 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  51.46 
 
 		 376 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  51.61 
 
 		 966 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  51.02 
 
 		 393 aa  101  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  49.5 
 
 		 436 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54 
 
 		 979 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  45.08 
 
 		 963 aa  99.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  53.26 
 
 		 1209 aa  99  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  33.77 
 
 		 875 aa  98.2  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  49.52 
 
 		 785 aa  98.2  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  44.23 
 
 		 489 aa  98.2  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  37.96 
 
 		 762 aa  97.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.54 
 
 		 794 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 628 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 658 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 611 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  49.49 
 
 		 525 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 589 aa  94.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  42.34 
 
 		 436 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51.09 
 
 		 763 aa  94  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.5 
 
 		 438 aa  93.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 1128 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.85 
 
 		 729 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 1137 aa  92.8  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 620 aa  92.8  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.47 
 
 		 590 aa  92  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  39.39 
 
 		 2170 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  35.57 
 
 		 864 aa  91.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  48.45 
 
 		 596 aa  91.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  49.04 
 
 		 681 aa  91.3  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  44.25 
 
 		 854 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  44 
 
 		 364 aa  91.3  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  46.15 
 
 		 442 aa  90.9  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  47 
 
 		 925 aa  90.9  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  44.44 
 
 		 491 aa  90.9  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  48.91 
 
 		 403 aa  90.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 894 aa  89.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  39.66 
 
 		 609 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  43.14 
 
 		 990 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  45 
 
 		 773 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  47.96 
 
 		 487 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.84 
 
 		 486 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  52.33 
 
 		 1298 aa  88.2  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  45.45 
 
 		 432 aa  87.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.42 
 
 		 420 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.81 
 
 		 913 aa  87.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  37.2 
 
 		 460 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.9 
 
 		 812 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.57 
 
 		 934 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  45.56 
 
 		 562 aa  87  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  34.69 
 
 		 851 aa  86.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  43 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  34.63 
 
 		 1887 aa  85.1  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  45.92 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.42 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 846 aa  85.1  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  42.16 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.39 
 
 		 474 aa  84  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  45.65 
 
 		 598 aa  84  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.33 
 
 		 690 aa  84.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.44 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  39.58 
 
 		 906 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.84 
 
 		 746 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  44.12 
 
 		 580 aa  83.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 1121 aa  83.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  42.42 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.86 
 
 		 674 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  40.38 
 
 		 854 aa  83.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>