More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4214 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  81.44 
 
 		 562 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 608 aa  1219    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  51.67 
 
 		 2305 aa  364  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  50.7 
 
 		 2310 aa  353  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  38.31 
 
 		 649 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  35.02 
 
 		 658 aa  319  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  42.74 
 
 		 542 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  42.22 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  44.06 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  38.57 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  34.77 
 
 		 1414 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 660 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  35.16 
 
 		 580 aa  223  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  33.94 
 
 		 619 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  34.2 
 
 		 597 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  31.43 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  57.43 
 
 		 743 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  32.44 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  32.01 
 
 		 468 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  62.89 
 
 		 973 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  58.13 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  30.67 
 
 		 539 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  48.04 
 
 		 847 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 440 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  47.96 
 
 		 1121 aa  156  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  36.69 
 
 		 543 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 1137 aa  136  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.72 
 
 		 880 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  45.86 
 
 		 727 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  42.86 
 
 		 523 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  40.2 
 
 		 978 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.79 
 
 		 681 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.82 
 
 		 998 aa  127  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  47.24 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.02 
 
 		 655 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  34.06 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  44.07 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  33.62 
 
 		 584 aa  120  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  43.98 
 
 		 900 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  40.1 
 
 		 637 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  28.35 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  26.93 
 
 		 632 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  56.38 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  52.53 
 
 		 403 aa  100  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  36.73 
 
 		 1007 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51 
 
 		 763 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  67.9 
 
 		 561 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  37.88 
 
 		 938 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.02 
 
 		 1209 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.21 
 
 		 688 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.52 
 
 		 795 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  49.51 
 
 		 1154 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  55 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  43.55 
 
 		 518 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  33.98 
 
 		 385 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  33.88 
 
 		 674 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46 
 
 		 474 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  32.8 
 
 		 674 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  48.91 
 
 		 609 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.44 
 
 		 6885 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  48 
 
 		 494 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  50.56 
 
 		 455 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  49.44 
 
 		 455 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  50.56 
 
 		 455 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  52.53 
 
 		 762 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.33 
 
 		 674 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  52.08 
 
 		 420 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 674 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  24.85 
 
 		 590 aa  90.1  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  50.56 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  24.52 
 
 		 725 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  48.31 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  27.48 
 
 		 651 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.33 
 
 		 674 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  58.76 
 
 		 924 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  48.31 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  47.19 
 
 		 455 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  53.51 
 
 		 562 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  50.56 
 
 		 455 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1200 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  39.58 
 
 		 679 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.65 
 
 		 778 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.57 
 
 		 984 aa  87.4  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.42 
 
 		 674 aa  87  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  56.04 
 
 		 854 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  48.31 
 
 		 455 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  48.31 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  47.25 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  48.89 
 
 		 749 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.65 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>