More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2792 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  100 
 
 		 681 aa  1371    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  66.33 
 
 		 629 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  62.05 
 
 		 630 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  50.64 
 
 		 1217 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  42.28 
 
 		 406 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  41.67 
 
 		 413 aa  297  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  63.16 
 
 		 543 aa  237  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.8 
 
 		 998 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  51.03 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  49.55 
 
 		 429 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  29.45 
 
 		 532 aa  157  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  45.41 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  29.31 
 
 		 688 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  47.39 
 
 		 880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  45.32 
 
 		 978 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.5 
 
 		 847 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  47.29 
 
 		 743 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.92 
 
 		 658 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 637 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  43.88 
 
 		 523 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  44.1 
 
 		 608 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  45.36 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.67 
 
 		 655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  46.28 
 
 		 900 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  30.5 
 
 		 699 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 938 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  53.92 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  48.17 
 
 		 973 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.93 
 
 		 649 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  52.94 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  45.59 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 		 674 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35 
 
 		 674 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  34.54 
 
 		 674 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.9 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.38 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.57 
 
 		 913 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  38.69 
 
 		 1007 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.43 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  52.29 
 
 		 494 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  40.79 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 925 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 		 623 aa  100  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50.98 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 674 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  33.68 
 
 		 674 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.36 
 
 		 1121 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 1137 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 842 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.02 
 
 		 743 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  33.51 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  35.9 
 
 		 385 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.68 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  33.51 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  49.04 
 
 		 489 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  49.02 
 
 		 974 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.99 
 
 		 674 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  35.27 
 
 		 679 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  54.55 
 
 		 829 aa  97.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  49.02 
 
 		 459 aa  96.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  49.04 
 
 		 393 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 597 aa  95.1  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 455 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 934 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.14 
 
 		 773 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  45.63 
 
 		 906 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  44.23 
 
 		 875 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.06 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  55.14 
 
 		 614 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.48 
 
 		 474 aa  90.5  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.43 
 
 		 456 aa  90.5  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 1055 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.23 
 
 		 846 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.14 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.35 
 
 		 864 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  44.66 
 
 		 580 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  45.63 
 
 		 611 aa  89  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  46.6 
 
 		 990 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  50.88 
 
 		 1154 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.88 
 
 		 422 aa  87.8  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  46.08 
 
 		 596 aa  87.8  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  42.99 
 
 		 851 aa  87.4  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  44.66 
 
 		 775 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  44.66 
 
 		 436 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.42 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  45.1 
 
 		 605 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  46.79 
 
 		 785 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.05 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  43.3 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.74 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 854 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.14 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.63 
 
 		 979 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.83 
 
 		 984 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  41.35 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 1128 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  43.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  43.27 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  41.18 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  42 
 
 		 652 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>