63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0327 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  71.17 
 
 
1195 aa  1005    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
1221 aa  2508    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.44 
 
 
810 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.38 
 
 
714 aa  360  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.47 
 
 
1126 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.62 
 
 
540 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.89 
 
 
826 aa  349  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.67 
 
 
805 aa  348  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.74 
 
 
1607 aa  347  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  52.56 
 
 
633 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  55.66 
 
 
1848 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  52.68 
 
 
1026 aa  345  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.41 
 
 
1183 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.98 
 
 
1383 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  53.18 
 
 
1178 aa  336  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
721 aa  332  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.13 
 
 
1507 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.77 
 
 
1292 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.96 
 
 
701 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  50.71 
 
 
920 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.14 
 
 
408 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  51.94 
 
 
2802 aa  310  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.84 
 
 
887 aa  308  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  48.66 
 
 
884 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  47.38 
 
 
1255 aa  305  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.8 
 
 
1130 aa  304  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  49.09 
 
 
462 aa  302  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  46.2 
 
 
862 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  48.04 
 
 
640 aa  293  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  55.22 
 
 
1285 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  51.18 
 
 
933 aa  289  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  47.8 
 
 
1176 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  48.48 
 
 
791 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  43.3 
 
 
485 aa  267  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.34 
 
 
1176 aa  262  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.69 
 
 
664 aa  258  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.48 
 
 
648 aa  251  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  42.51 
 
 
3563 aa  237  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.13 
 
 
488 aa  211  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  46.15 
 
 
288 aa  209  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.84 
 
 
474 aa  204  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  40.75 
 
 
308 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  38.59 
 
 
492 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  39.47 
 
 
325 aa  195  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  41.89 
 
 
829 aa  190  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.36 
 
 
520 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.66 
 
 
507 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  44.91 
 
 
1083 aa  156  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  34.32 
 
 
536 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  34.47 
 
 
780 aa  155  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  37.12 
 
 
2003 aa  79  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.52 
 
 
1362 aa  78.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  41.84 
 
 
1550 aa  72.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  51.52 
 
 
972 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.97 
 
 
1132 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  44.71 
 
 
1969 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.47 
 
 
14944 aa  56.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1423  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.75 
 
 
139 aa  55.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  38.96 
 
 
1657 aa  49.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  42.11 
 
 
1976 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  39.08 
 
 
1105 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  34.41 
 
 
441 aa  47  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  34.91 
 
 
532 aa  45.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>