80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3031 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.27 
 
 		 998 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.76 
 
 		 786 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  52.16 
 
 		 851 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  51.14 
 
 		 1100 aa  904    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 1105 aa  2215    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  51.25 
 
 		 864 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.72 
 
 		 762 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.85 
 
 		 927 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.44 
 
 		 875 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.92 
 
 		 812 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 1224 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  38.9 
 
 		 895 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  48.15 
 
 		 775 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.62 
 
 		 867 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  34.2 
 
 		 885 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  33.82 
 
 		 874 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.6 
 
 		 611 aa  321  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  32.41 
 
 		 854 aa  239  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  29.33 
 
 		 571 aa  224  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.83 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  30.08 
 
 		 587 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  29.27 
 
 		 591 aa  207  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  30.46 
 
 		 578 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 		 649 aa  206  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  28.43 
 
 		 646 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 1601 aa  189  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.32 
 
 		 833 aa  168  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  28.92 
 
 		 537 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.11 
 
 		 900 aa  113  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.31 
 
 		 665 aa  111  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  25.47 
 
 		 739 aa  107  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.8 
 
 		 621 aa  88.6  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  28.39 
 
 		 803 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.55 
 
 		 1076 aa  87.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.9 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 606 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  23.7 
 
 		 880 aa  73.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.42 
 
 		 978 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.8 
 
 		 2042 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  48.35 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.43 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  44.79 
 
 		 1127 aa  62.4  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  22.29 
 
 		 815 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  22.53 
 
 		 725 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  52.78 
 
 		 994 aa  58.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 736 aa  55.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  23.03 
 
 		 847 aa  55.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  26.14 
 
 		 653 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  36.36 
 
 		 979 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  24.95 
 
 		 789 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  19.81 
 
 		 707 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 611 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  41.67 
 
 		 3563 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  44.05 
 
 		 14944 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  42.86 
 
 		 1550 aa  52.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  22.72 
 
 		 526 aa  52  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 742 aa  52  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  46.99 
 
 		 800 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  21.69 
 
 		 563 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  20.96 
 
 		 887 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  21.56 
 
 		 730 aa  50.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  23.91 
 
 		 1017 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 961 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  39.22 
 
 		 1098 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  23.08 
 
 		 990 aa  48.5  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  23.15 
 
 		 715 aa  48.5  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.29 
 
 		 540 aa  48.5  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.11 
 
 		 985 aa  48.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.42 
 
 		 916 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  21.89 
 
 		 984 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.08 
 
 		 1221 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  35.92 
 
 		 760 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1243 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 894 aa  45.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  22.2 
 
 		 949 aa  45.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  36.05 
 
 		 1657 aa  44.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2743  glycoside hydrolase family protein  22.36 
 
 		 863 aa  44.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>