164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2848 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 520 aa  1051    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  68.89 
 
 		 474 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.94 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  95 
 
 		 829 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  53.42 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  73.18 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  67 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  65.89 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.14 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  60.59 
 
 		 495 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  60.84 
 
 		 691 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  38.41 
 
 		 1195 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.36 
 
 		 1221 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  65.97 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  58.05 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.71 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  44.57 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  46.99 
 
 		 560 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.99 
 
 		 1139 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40.13 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  40.85 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  43.4 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.43 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  43.15 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.32 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  31.44 
 
 		 780 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  30.39 
 
 		 536 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.57 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  45.93 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.79 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  40.85 
 
 		 497 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  40.44 
 
 		 884 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.53 
 
 		 1413 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  38.24 
 
 		 582 aa  93.6  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.71 
 
 		 957 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  37.74 
 
 		 897 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  34.62 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.39 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  36.76 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  38.3 
 
 		 672 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.59 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.42 
 
 		 943 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  36.17 
 
 		 771 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  33.56 
 
 		 230 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  32.33 
 
 		 963 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  36.13 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  35.03 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 		 618 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  34.39 
 
 		 1259 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.63 
 
 		 695 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.08 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.36 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.07 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.78 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.71 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.07 
 
 		 2073 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.84 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  40.74 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  32.89 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  34.59 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36.78 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 982 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  38.1 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.8 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.92 
 
 		 756 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1187 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  36.22 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.01 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 824 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  33.86 
 
 		 1567 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  35.62 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.97 
 
 		 1016 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  27.7 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  31.58 
 
 		 794 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  37.4 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  31.67 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  29.81 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  33.85 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 801 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  32.88 
 
 		 664 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  36.22 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 806 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  29.56 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  36.43 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  36.43 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  28.26 
 
 		 1222 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>