29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2228 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 403 aa  825    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  59.77 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  52.45 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.33 
 
 		 507 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  54.29 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  43 
 
 		 561 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  50.16 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  49.54 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  45.74 
 
 		 543 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  50.49 
 
 		 478 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  43.47 
 
 		 449 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  48.36 
 
 		 1294 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  47.72 
 
 		 1369 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  48.36 
 
 		 1414 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  30.5 
 
 		 732 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  28.74 
 
 		 558 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  30.36 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  25.2 
 
 		 850 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  29.59 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.88 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  26.97 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  22.67 
 
 		 1194 aa  44.3  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  22.87 
 
 		 505 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  24.85 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 556 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>