16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4515 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 357 aa  729    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  44.75 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  44.3 
 
 		 600 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2048  glycoside hydrolase family protein  44.37 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.904754  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  31.11 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  29.41 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  24.77 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  24.89 
 
 		 1369 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  25.36 
 
 		 1294 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  31.54 
 
 		 478 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  25.36 
 
 		 1414 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  25.29 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  28.77 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  21.8 
 
 		 850 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  29.05 
 
 		 543 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  27.92 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>