More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2006 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  100 
 
 		 1194 aa  2348    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  55.1 
 
 		 378 aa  385  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  39.5 
 
 		 562 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  37.92 
 
 		 504 aa  232  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  42.76 
 
 		 539 aa  228  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  42.86 
 
 		 451 aa  227  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  225  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 449 aa  225  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  44.05 
 
 		 453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  40.4 
 
 		 507 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  43.48 
 
 		 451 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  41.61 
 
 		 401 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  42.55 
 
 		 451 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  42.55 
 
 		 451 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  40.75 
 
 		 451 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  40.46 
 
 		 451 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  37.97 
 
 		 540 aa  203  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.73 
 
 		 2305 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  35.8 
 
 		 393 aa  189  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  38.68 
 
 		 537 aa  187  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  36.83 
 
 		 358 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  36.72 
 
 		 623 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  35.74 
 
 		 897 aa  184  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  35.74 
 
 		 897 aa  184  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  35.74 
 
 		 897 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  35.74 
 
 		 686 aa  183  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  35.74 
 
 		 686 aa  183  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  37.08 
 
 		 597 aa  175  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.31 
 
 		 2310 aa  172  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  34.59 
 
 		 593 aa  172  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  36.45 
 
 		 751 aa  172  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  41.89 
 
 		 315 aa  172  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  34.3 
 
 		 665 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  36.45 
 
 		 481 aa  169  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  37.42 
 
 		 324 aa  164  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  163  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  36.74 
 
 		 543 aa  160  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  41.48 
 
 		 452 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.83 
 
 		 490 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  37.64 
 
 		 426 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  35.83 
 
 		 465 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  30.75 
 
 		 548 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  32.37 
 
 		 525 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  33.55 
 
 		 591 aa  124  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.52 
 
 		 492 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  31.01 
 
 		 533 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.49 
 
 		 324 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.53 
 
 		 526 aa  122  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  29.66 
 
 		 358 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  31.54 
 
 		 552 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  31.29 
 
 		 561 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  30.7 
 
 		 421 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  28.52 
 
 		 338 aa  104  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  28.84 
 
 		 361 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 1055 aa  99  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  29.55 
 
 		 521 aa  95.5  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  27.86 
 
 		 358 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.85 
 
 		 514 aa  92.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  26.3 
 
 		 461 aa  90.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 566 aa  87.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  25.89 
 
 		 748 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  23.03 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.73 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  24.77 
 
 		 651 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  46.91 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  23.74 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  45.26 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.22 
 
 		 847 aa  72  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  24.04 
 
 		 505 aa  72  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 462 aa  72  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  41.9 
 
 		 1007 aa  72  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1080 aa  72  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.68 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  38.65 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  29.7 
 
 		 365 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 702 aa  71.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  45.36 
 
 		 442 aa  71.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  45.05 
 
 		 778 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  24.34 
 
 		 426 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  28.09 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  44.44 
 
 		 906 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40.57 
 
 		 623 aa  70.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40.57 
 
 		 842 aa  68.9  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  22.38 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  45.28 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  21.93 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  32.63 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  41.76 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>