112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  100 
 
 		 421 aa  851    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  60.31 
 
 		 591 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  44 
 
 		 526 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  41.02 
 
 		 492 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  39.86 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  38.31 
 
 		 561 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  37.2 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  32.82 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  31.59 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  32.83 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  30.55 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  31.99 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  31.99 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  30.57 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  30.57 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  31.99 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  32.07 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  33.24 
 
 		 597 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  31.07 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  32.11 
 
 		 539 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.01 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  34.21 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.79 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  27.47 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  29.64 
 
 		 665 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  30.1 
 
 		 1194 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.4 
 
 		 537 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  29.29 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  31.23 
 
 		 751 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  29.19 
 
 		 562 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  32 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  28.03 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 465 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  27.49 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  25.38 
 
 		 623 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  29.82 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.67 
 
 		 2305 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  24.75 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.11 
 
 		 2310 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  26.62 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  73.08 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  27.18 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  25.18 
 
 		 897 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  25.18 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  25.18 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  69.81 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  25.18 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  25.18 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  48.68 
 
 		 904 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  60.42 
 
 		 763 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  56.86 
 
 		 772 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  53.19 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  55.1 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  26.22 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  62.79 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  46.77 
 
 		 1057 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  48.21 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  45 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  25.65 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  42.62 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  54.55 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  49.06 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  44.12 
 
 		 848 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  57.14 
 
 		 868 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  43.37 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  24.53 
 
 		 461 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  27.68 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  54.76 
 
 		 868 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.19 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  54.76 
 
 		 868 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  45.16 
 
 		 1362 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  49.06 
 
 		 855 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 		 863 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.22 
 
 		 626 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  47.06 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  52.38 
 
 		 867 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 		 868 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.02 
 
 		 848 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  56.41 
 
 		 295 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  55 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  48.94 
 
 		 651 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  47.92 
 
 		 521 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  23.5 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  47.62 
 
 		 869 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 868 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 		 699 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 868 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.82 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 727 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>