89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5452 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  70.2 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  83.5 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  71.63 
 
 		 245 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  74.76 
 
 		 368 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  74.76 
 
 		 353 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  62.75 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  61.76 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  55.39 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  55.39 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  55.39 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  52.11 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  35.41 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  36.36 
 
 		 709 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  30.74 
 
 		 565 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  30.95 
 
 		 587 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  30.95 
 
 		 587 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  30.95 
 
 		 587 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  30.95 
 
 		 587 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  30.95 
 
 		 553 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  31.74 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  26.89 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  33.85 
 
 		 177 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  54.55 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  56.86 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  30.95 
 
 		 177 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  30.95 
 
 		 177 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  30.17 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  26.05 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  30.59 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  26.96 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  50.98 
 
 		 591 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  53.06 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  54.35 
 
 		 772 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  53.33 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  37.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  28.83 
 
 		 183 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.5 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  52.27 
 
 		 863 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 904 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  36.05 
 
 		 634 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 588 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  47.92 
 
 		 855 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  35.63 
 
 		 426 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  47.73 
 
 		 868 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  50 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  47.73 
 
 		 868 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  47.73 
 
 		 868 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  46.94 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 1577 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  35.71 
 
 		 600 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  32.43 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 		 727 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  46.15 
 
 		 1242 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35.8 
 
 		 855 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  25.84 
 
 		 1260 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.73 
 
 		 848 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.13 
 
 		 623 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  28.4 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  30.34 
 
 		 183 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  29.25 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  34.52 
 
 		 848 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  37.93 
 
 		 651 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 789 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  33.33 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  42.86 
 
 		 869 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  30.59 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  38.36 
 
 		 1054 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  40 
 
 		 443 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3792  Carbohydrate-binding family V/XII  45.1 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156874  normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  43.18 
 
 		 867 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  27.75 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  43.18 
 
 		 868 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.03 
 
 		 1053 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  43.18 
 
 		 868 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  43.18 
 
 		 868 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  30.43 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1057 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  36.49 
 
 		 540 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.16 
 
 		 1051 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  40.82 
 
 		 426 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.96 
 
 		 816 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 		 626 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>