85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0887 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  100 
 
 
540 aa  1078    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  40.12 
 
 
543 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  43.18 
 
 
537 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  44.51 
 
 
358 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  45.25 
 
 
393 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  36.66 
 
 
504 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
449 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 
453 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  36.19 
 
 
451 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  35.97 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  35.97 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  35.01 
 
 
451 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  33.54 
 
 
451 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  35.4 
 
 
451 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  38.06 
 
 
1194 aa  213  9e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  36.22 
 
 
401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  37.78 
 
 
539 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  38.05 
 
 
507 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  35.71 
 
 
897 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  35.71 
 
 
686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  35.71 
 
 
686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  35.71 
 
 
897 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  35.71 
 
 
897 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  34.39 
 
 
562 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  35.17 
 
 
2305 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  30.63 
 
 
593 aa  147  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30 
 
 
665 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.91 
 
 
2310 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  34.08 
 
 
751 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.19 
 
 
623 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  29.56 
 
 
324 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  33.87 
 
 
315 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  29.25 
 
 
324 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  31.45 
 
 
481 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  33.94 
 
 
358 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  29.23 
 
 
552 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  28.42 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  30.41 
 
 
597 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  29.46 
 
 
591 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  28.72 
 
 
338 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  34.09 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  30.62 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.43 
 
 
526 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  30.86 
 
 
465 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  26.95 
 
 
514 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  26.33 
 
 
421 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  25.82 
 
 
561 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  27.33 
 
 
324 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  26.91 
 
 
548 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  33.2 
 
 
361 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.55 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  30.04 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  28.4 
 
 
671 aa  67  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  27.63 
 
 
461 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
669 aa  63.9  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  34.25 
 
 
1577 aa  63.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  30.72 
 
 
393 aa  60.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.69 
 
 
985 aa  60.1  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
868 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
868 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.53 
 
 
868 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  30.67 
 
 
1260 aa  57.4  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.11 
 
 
867 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.81 
 
 
868 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  27.88 
 
 
365 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.24 
 
 
868 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.46 
 
 
869 aa  53.9  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  24.47 
 
 
521 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.48 
 
 
868 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  25.69 
 
 
657 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  32.14 
 
 
1242 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  52.08 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  31.48 
 
 
675 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  45.76 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  47.92 
 
 
855 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  31.25 
 
 
639 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  33.8 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  40 
 
 
772 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.83 
 
 
803 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  41.67 
 
 
426 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>