59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2747 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  100 
 
 		 671 aa  1330    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  56.33 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  52.22 
 
 		 436 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  31.15 
 
 		 324 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  30.82 
 
 		 324 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30.58 
 
 		 665 aa  120  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  29.51 
 
 		 593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  26.74 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  30.74 
 
 		 426 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  31.86 
 
 		 451 aa  101  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  31.49 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  31.86 
 
 		 451 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.8  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  30.63 
 
 		 504 aa  97.4  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  30.33 
 
 		 449 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  30.52 
 
 		 451 aa  94  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  30.52 
 
 		 451 aa  94  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  33.47 
 
 		 507 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.88 
 
 		 2305 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  29.22 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  30.4 
 
 		 751 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  29.62 
 
 		 451 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.52 
 
 		 2310 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.43 
 
 		 1194 aa  79  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  26.71 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  28.95 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  26.56 
 
 		 623 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  26.97 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  30.16 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  29.66 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  29.66 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  29.66 
 
 		 897 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  31.84 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  29.66 
 
 		 686 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  29.66 
 
 		 686 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.1 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  27.45 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  26.8 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  26.02 
 
 		 548 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  25.93 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  27.76 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  24.75 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  23.78 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  27.63 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  25.93 
 
 		 315 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  25.26 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  27.86 
 
 		 465 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  26.28 
 
 		 591 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 633 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  30.51 
 
 		 794 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  34.65 
 
 		 429 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  28.11 
 
 		 455 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  24.49 
 
 		 597 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  26.88 
 
 		 778 aa  44.3  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>