54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2281 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  45.04 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  35.34 
 
 		 539 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  33.79 
 
 		 562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  32.44 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  31.03 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  34.98 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  30.67 
 
 		 504 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  31.51 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  28.95 
 
 		 1194 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  30.34 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  31.48 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  30.34 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  32.38 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  33.61 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  30.33 
 
 		 451 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  31.1 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  30.08 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  28.63 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  29.15 
 
 		 597 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  27.64 
 
 		 593 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  27.24 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  32.26 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.58 
 
 		 2305 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  31.47 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.11 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  32.38 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  29.9 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.71 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  23.91 
 
 		 686 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  23.91 
 
 		 686 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  23.91 
 
 		 897 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.6 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  23.91 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  23.91 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  25.32 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  25.26 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  25.25 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  28.81 
 
 		 2310 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  26.22 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  24.02 
 
 		 552 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  21.68 
 
 		 514 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  24.26 
 
 		 521 aa  52.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  22.4 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  22.07 
 
 		 561 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  23.39 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  25.78 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>