158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2637 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  100 
 
 		 465 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  55.48 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  68.55 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  37.36 
 
 		 597 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  38.49 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  35.92 
 
 		 1194 aa  151  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  36.76 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  55.47 
 
 		 642 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  37.82 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  31.31 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30.97 
 
 		 623 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  33.21 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.32 
 
 		 2305 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  33.22 
 
 		 751 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  35.08 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  34.68 
 
 		 665 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  30.33 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  29.69 
 
 		 686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  29.69 
 
 		 897 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  29.69 
 
 		 897 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  29.69 
 
 		 686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  29.69 
 
 		 897 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  31.11 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  29.53 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  29.53 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.72 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  29.88 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  29.88 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  32.03 
 
 		 358 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  30.84 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  30.47 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  29.78 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  30.24 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  34.1 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  32.12 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  26.97 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  29.89 
 
 		 2310 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  31.34 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.88 
 
 		 526 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  28.24 
 
 		 561 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.41 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  31.25 
 
 		 537 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.19 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  30.86 
 
 		 540 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  38.85 
 
 		 801 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  31.76 
 
 		 548 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 521 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  32.08 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  31.08 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  30.6 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  40.16 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  24.62 
 
 		 338 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  25.45 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  41.53 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.84 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.88 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  31.52 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.02 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  37.68 
 
 		 801 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  27.07 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.5 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  36.07 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  34.42 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  36.75 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.6 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  38.26 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.35 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.48 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  35.54 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  35.29 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.71 
 
 		 1072 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  38.33 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.2 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  36.76 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  31.36 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.54 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.76 
 
 		 933 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  34.4 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.84 
 
 		 709 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.76 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.26 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  27.85 
 
 		 1207 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  32.5 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  36.13 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  33.33 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>