134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02194 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  100 
 
 		 985 aa  2029    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4351  hypothetical protein  46.44 
 
 		 885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000110268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4488  hypothetical protein  46.44 
 
 		 885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0001  hypothetical protein  42.93 
 
 		 898 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362485  normal  0.442936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30260  Peptidase M66  37.62 
 
 		 1056 aa  243  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  41.53 
 
 		 868 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  41.72 
 
 		 868 aa  229  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  40.58 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0345  ToxR-activated gene A protein  38.5 
 
 		 1013 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1129  TagA-related protein  37.13 
 
 		 1247 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000117742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 		 863 aa  212  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  38.02 
 
 		 868 aa  208  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 868 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  37.38 
 
 		 868 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  37.66 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.7 
 
 		 867 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02169  hypothetical protein  44.44 
 
 		 214 aa  143  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  33.07 
 
 		 855 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.25 
 
 		 848 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.44 
 
 		 972 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.3 
 
 		 848 aa  107  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1022 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  29.6 
 
 		 1057 aa  82  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  38.1 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  38.1 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  36.9 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  36.9 
 
 		 451 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 449 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  40.96 
 
 		 453 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  36.9 
 
 		 451 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  36.9 
 
 		 451 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  39.76 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  31.46 
 
 		 1011 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.44 
 
 		 1771 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  31.77 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.65 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.71 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 		 1212 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  27.31 
 
 		 833 aa  68.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  27.53 
 
 		 1107 aa  67.8  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02167  hypothetical protein  35.92 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  29.29 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  32.76 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  31.01 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  29.15 
 
 		 634 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  34.29 
 
 		 657 aa  64.3  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.44 
 
 		 861 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  28.28 
 
 		 1393 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  30.83 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  26.26 
 
 		 1393 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  39.45 
 
 		 675 aa  62  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  38.46 
 
 		 563 aa  60.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  29.69 
 
 		 540 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  26.83 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  30.89 
 
 		 1242 aa  60.1  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  34.21 
 
 		 1418 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.58 
 
 		 1577 aa  59.7  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.48 
 
 		 1217 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.77 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.69 
 
 		 1331 aa  58.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  31.91 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.93 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  25.49 
 
 		 656 aa  57.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.71 
 
 		 1421 aa  57  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  24.68 
 
 		 765 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  26.21 
 
 		 1260 aa  57  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.82 
 
 		 1779 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  28 
 
 		 901 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  37.5 
 
 		 699 aa  55.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  41.76 
 
 		 553 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  26.19 
 
 		 902 aa  55.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  41.76 
 
 		 587 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  41.76 
 
 		 587 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  41.76 
 
 		 587 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  41.76 
 
 		 587 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  32.73 
 
 		 665 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  27.08 
 
 		 3278 aa  54.7  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  32.39 
 
 		 1376 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  33.1 
 
 		 506 aa  53.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1111  hypothetical protein  22.42 
 
 		 604 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.835196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  53.66 
 
 		 855 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.29 
 
 		 911 aa  53.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0314  hypothetical protein  22.42 
 
 		 629 aa  52.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0262  hypothetical protein  21.97 
 
 		 729 aa  52.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  30.91 
 
 		 665 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.08 
 
 		 1362 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  48.78 
 
 		 359 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.69 
 
 		 1004 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  27.27 
 
 		 537 aa  49.7  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  51.35 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  29.55 
 
 		 565 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.18 
 
 		 2656 aa  48.5  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  31.31 
 
 		 950 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>