21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4351 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011665  Sbal223_4488  hypothetical protein  100 
 
 
885 aa  1827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018455  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4351  hypothetical protein  100 
 
 
885 aa  1827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000110268  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0001  hypothetical protein  70.48 
 
 
898 aa  1321    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362485  normal  0.442936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  46.44 
 
 
985 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0345  ToxR-activated gene A protein  41.19 
 
 
1013 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1129  TagA-related protein  38.42 
 
 
1247 aa  188  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000117742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30260  Peptidase M66  36.5 
 
 
1056 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02169  hypothetical protein  46.08 
 
 
214 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0455  hypothetical protein  58.7 
 
 
957 aa  118  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3097  hypothetical protein  55.56 
 
 
473 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0262  hypothetical protein  25.3 
 
 
729 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1111  hypothetical protein  25.81 
 
 
604 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.835196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0314  hypothetical protein  25.81 
 
 
629 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1281  hypothetical protein  25.51 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1698  hypothetical protein  25.51 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1784  hypothetical protein  25.51 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0112  hypothetical protein  25.51 
 
 
687 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0575  hypothetical protein  37.65 
 
 
762 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0600  hypothetical protein  37.65 
 
 
762 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147074  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0606  hypothetical protein  37.65 
 
 
762 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02167  hypothetical protein  32.67 
 
 
671 aa  52  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>