96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1743 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  100 
 
 		 635 aa  1251    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  98.27 
 
 		 635 aa  1230    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  88.98 
 
 		 634 aa  1082    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  40.25 
 
 		 1011 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1393  hypothetical protein  34.95 
 
 		 456 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  37.96 
 
 		 1376 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1022 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  28.32 
 
 		 719 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1394  hypothetical protein  27.72 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  41.57 
 
 		 706 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.31 
 
 		 1750 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.28 
 
 		 833 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  30.29 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  33.56 
 
 		 1771 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.09 
 
 		 1217 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.63 
 
 		 972 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  39.39 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  31.37 
 
 		 1107 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.56 
 
 		 855 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.62 
 
 		 1212 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44 
 
 		 1004 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.98 
 
 		 848 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.68 
 
 		 867 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 868 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  35.5 
 
 		 868 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.96 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  35.68 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  37.56 
 
 		 868 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  35.18 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  38.83 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  35 
 
 		 868 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  43.43 
 
 		 835 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1512 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  34.53 
 
 		 1779 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36.52 
 
 		 1057 aa  67.4  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1601 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.29 
 
 		 985 aa  65.1  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  44 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.52 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 863 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  33.66 
 
 		 861 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  33.75 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  37.06 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  33.58 
 
 		 3197 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.96 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.51 
 
 		 3197 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.5 
 
 		 1565 aa  57.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0702  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  29.8 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463009  normal  0.0291956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.22 
 
 		 3699 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0603  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1090 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1608 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  34.03 
 
 		 1081 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  37.6 
 
 		 400 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  37.25 
 
 		 712 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  40.52 
 
 		 665 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  29.21 
 
 		 873 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  35.82 
 
 		 1150 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.4 
 
 		 816 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  36.54 
 
 		 1098 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  25.77 
 
 		 3278 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  28.51 
 
 		 1204 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  27.23 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  28.44 
 
 		 1631 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  31.49 
 
 		 1393 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3031  hypothetical protein  31.65 
 
 		 465 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  31.9 
 
 		 884 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1208 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.56 
 
 		 746 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  33.46 
 
 		 1084 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.23 
 
 		 913 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.27 
 
 		 4071 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  37.29 
 
 		 665 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  26.92 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  36.03 
 
 		 969 aa  48.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  35.48 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1916 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  31.82 
 
 		 901 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  26.99 
 
 		 989 aa  47.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  33.68 
 
 		 1418 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  30.85 
 
 		 902 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  28.89 
 
 		 1393 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1479  S-layer domain protein  29.88 
 
 		 1545 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1416 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37 
 
 		 953 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  41.41 
 
 		 1011 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  40 
 
 		 1363 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.18 
 
 		 623 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1432  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1175 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.974994  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.88 
 
 		 3927 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0860  hypothetical protein  30.33 
 
 		 956 aa  44.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.61 
 
 		 945 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  31.37 
 
 		 861 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  27.19 
 
 		 2454 aa  43.9  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  24.74 
 
 		 2491 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 682 aa  43.9  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 674 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>