22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2448 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  100 
 
 		 1363 aa  2749    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  42.6 
 
 		 1419 aa  1014    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.46 
 
 		 946 aa  1264    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  42.75 
 
 		 468 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.5 
 
 		 785 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  41.48 
 
 		 772 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  41.1 
 
 		 781 aa  105  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  24.49 
 
 		 1309 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  23.65 
 
 		 668 aa  82.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  20.67 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  21.33 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  31.09 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  21.28 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.5 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.57 
 
 		 1781 aa  58.2  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  22.36 
 
 		 516 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08432  conserved hypothetical protein  21.08 
 
 		 637 aa  55.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  20.6 
 
 		 533 aa  52.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  30.77 
 
 		 1355 aa  48.9  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  40.32 
 
 		 1686 aa  47.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  42.11 
 
 		 634 aa  45.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  40 
 
 		 635 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>