13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1813 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  59.05 
 
 		 515 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1091    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  49.6 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  47.32 
 
 		 516 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  43.3 
 
 		 533 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.87 
 
 		 785 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  36.85 
 
 		 668 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08432  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 		 637 aa  246  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  21.28 
 
 		 1363 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  35 
 
 		 1419 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.37 
 
 		 946 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  23.16 
 
 		 681 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  19.71 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>